86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3210 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  52.86 
 
 		 3563 aa  899    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  51.12 
 
 		 2904 aa  841    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  100 
 
 		 991 aa  1995    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  87.62 
 
 		 6274 aa  1095    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  64.3 
 
 		 5212 aa  774    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  56.16 
 
 		 3443 aa  979    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  46.78 
 
 		 980 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  40.3 
 
 		 2758 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.83 
 
 		 3790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.23 
 
 		 2670 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.7 
 
 		 3796 aa  218  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.97 
 
 		 3967 aa  212  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.39 
 
 		 3862 aa  204  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.84 
 
 		 2600 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.2 
 
 		 5981 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  31.91 
 
 		 3081 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  31.66 
 
 		 3300 aa  193  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  30.13 
 
 		 3301 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.14 
 
 		 3028 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.77 
 
 		 3020 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30 
 
 		 3040 aa  184  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  29.22 
 
 		 3526 aa  183  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  29.31 
 
 		 2588 aa  183  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.34 
 
 		 2545 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  29.65 
 
 		 2530 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.41 
 
 		 3079 aa  179  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  31.85 
 
 		 1998 aa  177  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  34.75 
 
 		 3004 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.47 
 
 		 2421 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.38 
 
 		 3884 aa  174  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  32.6 
 
 		 3322 aa  174  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.03 
 
 		 3128 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  32.19 
 
 		 3501 aa  170  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  32.19 
 
 		 3552 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.06 
 
 		 2345 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  33.33 
 
 		 2984 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  28.25 
 
 		 3350 aa  162  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  28.5 
 
 		 3141 aa  162  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  28.5 
 
 		 3141 aa  161  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  28.74 
 
 		 3141 aa  161  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  30.13 
 
 		 2547 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  27.09 
 
 		 3144 aa  158  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.27 
 
 		 3785 aa  157  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  24.18 
 
 		 1723 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  30.75 
 
 		 2964 aa  154  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  27.06 
 
 		 2827 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  30.35 
 
 		 3165 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  29.35 
 
 		 2651 aa  147  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  28.98 
 
 		 2732 aa  145  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.71 
 
 		 3602 aa  144  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  29.21 
 
 		 4966 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  26.94 
 
 		 3131 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.31 
 
 		 2782 aa  138  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3880  adhesin HecA family  29.19 
 
 		 2542 aa  137  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  29.4 
 
 		 3147 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  28.87 
 
 		 3159 aa  135  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0366  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  28.71 
 
 		 1571 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.11 
 
 		 3475 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.29 
 
 		 3480 aa  109  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.29 
 
 		 3378 aa  108  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0582  putative adhesin/hemolysin  42.98 
 
 		 265 aa  98.6  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.588513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3227  hypothetical protein  92.68 
 
 		 42 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0201844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1481  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1275 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2791  putative filamentous haemagglutinin  43.97 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.258369  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  29.47 
 
 		 2449 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0363  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  24.28 
 
 		 557 aa  70.5  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  28.52 
 
 		 1719 aa  65.5  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2308  protein of unknown function DUF637 hemagglutinin putative  29.27 
 
 		 637 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  34.38 
 
 		 2536 aa  55.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2583  hypothetical protein  27.78 
 
 		 332 aa  54.7  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  30.61 
 
 		 2737 aa  54.3  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  29.53 
 
 		 2751 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  28.66 
 
 		 2691 aa  52.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2923  hypothetical protein  28.02 
 
 		 761 aa  52.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2928  adhesin  28.02 
 
 		 1035 aa  51.2  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0514  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1268 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.140024  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.88 
 
 		 2818 aa  48.9  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2782  hemagglutinin  29.14 
 
 		 576 aa  47.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.92 
 
 		 2786 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  29.05 
 
 		 3929 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  27.39 
 
 		 2350 aa  46.2  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4486  metalloendopeptidase  32.52 
 
 		 306 aa  45.8  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.604115  normal  0.0822021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2788  hypothetical protein  40 
 
 		 381 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1480  hypothetical protein  29.37 
 
 		 892 aa  45.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2790  hypothetical protein  41.94 
 
 		 355 aa  45.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  22.87 
 
 		 1651 aa  45.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>