14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0945 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  79.01 
 
 		 1323 aa  2110    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 1331 aa  2711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  24.26 
 
 		 1882 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  35 
 
 		 691 aa  63.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  35.24 
 
 		 476 aa  57  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1052 aa  55.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  22.08 
 
 		 456 aa  54.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  30.25 
 
 		 458 aa  52  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 399 aa  48.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  24.14 
 
 		 2495 aa  48.9  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  27.78 
 
 		 269 aa  48.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  25.93 
 
 		 578 aa  45.8  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  34.92 
 
 		 293 aa  45.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>