27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  35.92 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35 
 
 		 1882 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  31.74 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  32.61 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  29.69 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 395 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  39.29 
 
 		 476 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  22.37 
 
 		 352 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  26.75 
 
 		 460 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  33.33 
 
 		 2392 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  30 
 
 		 1052 aa  52.4  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  43.94 
 
 		 269 aa  51.6  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  26.12 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  27.64 
 
 		 361 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1247 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.27 
 
 		 1842 aa  48.9  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 589 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  38.6 
 
 		 1518 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  32.91 
 
 		 355 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 399 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  30.59 
 
 		 456 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.71 
 
 		 2495 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  32.05 
 
 		 1732 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  32.97 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  37.1 
 
 		 506 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  31.58 
 
 		 458 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>