16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0223 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  215  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  56.41 
 
 
352 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  53.62 
 
 
589 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  49.28 
 
 
203 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  37.89 
 
 
293 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  37.5 
 
 
456 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  45.45 
 
 
297 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.46 
 
 
1842 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  39.44 
 
 
1052 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
399 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  48.72 
 
 
2495 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  39.74 
 
 
1055 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.22 
 
 
1882 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  61.76 
 
 
269 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>