24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1979 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  100 
 
 
2031 aa  4137    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  38.68 
 
 
2392 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  48.19 
 
 
1732 aa  155  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  79.69 
 
 
967 aa  110  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  66.23 
 
 
875 aa  107  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1987  hypothetical protein  45.3 
 
 
384 aa  100  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0946014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  66.67 
 
 
834 aa  83.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  50 
 
 
1143 aa  80.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  30.28 
 
 
1502 aa  77.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  66 
 
 
484 aa  77  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  47.54 
 
 
556 aa  66.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.44 
 
 
1052 aa  65.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  29.86 
 
 
476 aa  58.2  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  32.12 
 
 
1882 aa  55.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  33.59 
 
 
1247 aa  55.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  27.12 
 
 
271 aa  54.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.3 
 
 
361 aa  53.5  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  26.76 
 
 
225 aa  52.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  31.82 
 
 
1518 aa  51.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  28 
 
 
395 aa  50.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  31.43 
 
 
460 aa  48.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  25.64 
 
 
270 aa  47.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.5 
 
 
1842 aa  47  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  37.21 
 
 
458 aa  47  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>