14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1972 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  100 
 
 
1502 aa  3073    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  89.47 
 
 
1732 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  70 
 
 
1143 aa  92  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  70.37 
 
 
2392 aa  90.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  45.45 
 
 
834 aa  89.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  69.81 
 
 
484 aa  83.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  29.85 
 
 
2031 aa  79.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  58.33 
 
 
556 aa  77.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  56.9 
 
 
967 aa  71.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  54.72 
 
 
875 aa  68.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0990  hypothetical protein  44.44 
 
 
221 aa  48.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0137361  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1027  hypothetical protein  38.89 
 
 
297 aa  47  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.49407  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  43.14 
 
 
1126 aa  45.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  30.65 
 
 
874 aa  45.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>