30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0990 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0990  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0137361  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04630  hypothetical protein  54.08 
 
 
246 aa  106  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1027  hypothetical protein  43.14 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.49407  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2116  hypothetical protein  35.43 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.292016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3107  hypothetical protein  35.25 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3120  putative lipoprotein  41.33 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3366  putative lipoprotein  41.33 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3325  putative lipoprotein  41.33 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1912  putative lipoprotein  39.74 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3045  hypothetical protein  41.33 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3319  putative lipoprotein  39.74 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3010  lipoprotein  39.74 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.679131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3339  putative lipoprotein  38.46 
 
 
280 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0442222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3339  putative lipoprotein  41.33 
 
 
277 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  40.58 
 
 
1238 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3367  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 
595 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3011  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 
604 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0165682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3108  hypothetical protein  32.65 
 
 
594 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.65 
 
 
588 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00745561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3121  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 
605 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.65 
 
 
607 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3326  cell wall anchor domain-containing protein  32.65 
 
 
608 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  30.61 
 
 
598 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  44.44 
 
 
1502 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1910  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.61 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3320  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.61 
 
 
615 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.96 
 
 
1009 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2117  cell wall anchor domain-containing protein  29.47 
 
 
588 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.853164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  40.38 
 
 
1168 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  37.5 
 
 
2031 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>