66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1375 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  100 
 
 		 1238 aa  2490    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.87 
 
 		 1812 aa  97.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.41 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  22.47 
 
 		 2036 aa  60.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  22.47 
 
 		 1969 aa  60.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 		 1454 aa  59.3  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0990  hypothetical protein  40.58 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0137361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  24.49 
 
 		 445 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  22.17 
 
 		 2272 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 463 aa  55.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 		 834 aa  54.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1067 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  34.71 
 
 		 963 aa  53.5  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 		 1383 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.48 
 
 		 402 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 619 aa  53.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  29.75 
 
 		 1168 aa  52.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 		 809 aa  52.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.09 
 
 		 901 aa  52.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  21.91 
 
 		 1241 aa  52.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.56 
 
 		 432 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  30.43 
 
 		 1328 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  23.87 
 
 		 415 aa  51.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  35.09 
 
 		 797 aa  51.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 448 aa  51.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  35.14 
 
 		 932 aa  51.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  23.8 
 
 		 420 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.96 
 
 		 458 aa  50.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1458  hypothetical protein  38.36 
 
 		 252 aa  49.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 1174 aa  49.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2679  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  49.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  34.56 
 
 		 392 aa  49.3  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3107  hypothetical protein  28.46 
 
 		 275 aa  49.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0179  hypothetical protein  27.34 
 
 		 544 aa  48.9  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  27.8 
 
 		 450 aa  48.5  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1980 aa  48.5  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.63 
 
 		 1842 aa  48.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  20.91 
 
 		 374 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 		 484 aa  47.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  35.51 
 
 		 581 aa  47.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 		 447 aa  48.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 		 934 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  35.44 
 
 		 1311 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 611 aa  47.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 		 795 aa  47.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04630  hypothetical protein  31.88 
 
 		 246 aa  47  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 		 392 aa  47.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 		 392 aa  47.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.17 
 
 		 392 aa  47.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  29.75 
 
 		 678 aa  47  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  39.13 
 
 		 399 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.17 
 
 		 392 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.17 
 
 		 392 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 774 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.17 
 
 		 392 aa  47.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 		 727 aa  46.2  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 687 aa  46.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  32.61 
 
 		 675 aa  46.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  30.68 
 
 		 754 aa  45.8  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  24.84 
 
 		 530 aa  45.8  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 652 aa  45.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.83 
 
 		 392 aa  45.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.83 
 
 		 392 aa  45.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  31.48 
 
 		 411 aa  45.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.93 
 
 		 392 aa  45.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  23.93 
 
 		 455 aa  44.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>