223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1964 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
834 aa  1703    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  34.82 
 
 
809 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  34.88 
 
 
797 aa  362  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  44.19 
 
 
1969 aa  334  5e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  44.19 
 
 
2036 aa  333  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  42.05 
 
 
2272 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  41.05 
 
 
1067 aa  310  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  37.62 
 
 
1009 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  34.64 
 
 
656 aa  207  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 
484 aa  188  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  33.72 
 
 
1328 aa  187  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.16 
 
 
1241 aa  187  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  30.5 
 
 
1311 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  30.25 
 
 
635 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  32.77 
 
 
1842 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  30.19 
 
 
612 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  29.44 
 
 
626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  24.83 
 
 
430 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  26.02 
 
 
556 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.99 
 
 
431 aa  91.7  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1972  hypothetical protein  45.45 
 
 
1502 aa  89.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231233  hitchhiker  0.000116216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  58.73 
 
 
1732 aa  87.8  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  66.04 
 
 
2392 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  66.67 
 
 
2031 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1969  GLUG domain protein  52.17 
 
 
1143 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000014348  decreased coverage  0.000000694878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  26.41 
 
 
1812 aa  80.9  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  23.26 
 
 
645 aa  80.1  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
687 aa  77.8  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 
652 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  58.82 
 
 
967 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1977  hypothetical protein  55.74 
 
 
875 aa  75.5  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00338122  hitchhiker  0.000166946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
616 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.66 
 
 
463 aa  73.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  26.64 
 
 
653 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  27.31 
 
 
1533 aa  71.6  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.8 
 
 
1682 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.37 
 
 
514 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.53 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  29.46 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  26.63 
 
 
1454 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 
774 aa  67.8  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.74 
 
 
352 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.88 
 
 
1383 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  24.32 
 
 
384 aa  66.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 
795 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  25.07 
 
 
619 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  24.6 
 
 
475 aa  64.7  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  24.93 
 
 
963 aa  64.3  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 
397 aa  64.3  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3497  Pyrrolo-quinoline quinone  25.4 
 
 
379 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.21 
 
 
1300 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0991  Pyrrolo-quinoline quinone  21.51 
 
 
1261 aa  63.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.620303  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  23.77 
 
 
396 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  30.3 
 
 
461 aa  62  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.41 
 
 
611 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  25.34 
 
 
611 aa  61.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  22.94 
 
 
322 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 
322 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.17 
 
 
432 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 
322 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  25.18 
 
 
705 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  25.69 
 
 
901 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0899  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.02 
 
 
380 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000144468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 
407 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 
365 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  24.11 
 
 
469 aa  58.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.05 
 
 
392 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.05 
 
 
392 aa  58.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 
454 aa  58.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.84 
 
 
393 aa  58.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.79 
 
 
395 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  27.87 
 
 
372 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  26.57 
 
 
445 aa  56.6  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.69 
 
 
392 aa  57  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0856  hypothetical protein  23.9 
 
 
380 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  30.07 
 
 
570 aa  55.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1829  Pyrrolo-quinoline quinone  23.33 
 
 
436 aa  55.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  24.1 
 
 
417 aa  55.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  24.19 
 
 
383 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.37 
 
 
393 aa  55.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0886  Pyrrolo-quinoline quinone  23.9 
 
 
380 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80102  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4322  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.18 
 
 
389 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  24.44 
 
 
1238 aa  54.7  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.46 
 
 
363 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.83 
 
 
475 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  22.62 
 
 
618 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.77 
 
 
392 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.14 
 
 
386 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 
562 aa  53.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.32 
 
 
391 aa  53.5  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5016  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.5 
 
 
393 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0245337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>