35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0947 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  558  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  83.39 
 
 
271 aa  442  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  62.41 
 
 
275 aa  304  9.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  42.65 
 
 
278 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  35.38 
 
 
395 aa  112  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  29.44 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  32.94 
 
 
355 aa  68.9  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.25 
 
 
1882 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  33.74 
 
 
460 aa  65.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  28.75 
 
 
1518 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  26.05 
 
 
361 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  29.75 
 
 
1842 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.77 
 
 
1052 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  26.22 
 
 
1732 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  27.97 
 
 
352 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf080  hypothetical lipoprotein  32.33 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0504565  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  29.73 
 
 
657 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  27.41 
 
 
476 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  29.71 
 
 
290 aa  49.3  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  26.79 
 
 
456 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  24.84 
 
 
2392 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
589 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1865  protein of unknown function DUF805  28.28 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0106422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0978  hypothetical protein  27.52 
 
 
158 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0120039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  25.27 
 
 
1055 aa  47  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  32.43 
 
 
2495 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  39.68 
 
 
458 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  25.64 
 
 
2031 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  24.71 
 
 
320 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  32.56 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  26.51 
 
 
730 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  35.71 
 
 
1247 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  25.95 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
399 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>