33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1220 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.38 
 
 		 1882 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  36.36 
 
 		 1842 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  37 
 
 		 1052 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  38.82 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  41.1 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  40.28 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  37.97 
 
 		 1732 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  41.18 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  36.36 
 
 		 1518 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  28.48 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  47.37 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  34.38 
 
 		 2392 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0223  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.304075  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  43.28 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  46.15 
 
 		 2495 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  31.51 
 
 		 456 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  32.73 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  30.59 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  37.14 
 
 		 434 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  45.21 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  37.84 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1247 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  29.49 
 
 		 730 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  38.03 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  40 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  37.31 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1055 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2492  hypothetical protein  20.92 
 
 		 660 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  30.77 
 
 		 691 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>