27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0948 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  563  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  43.73 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  42.65 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  42.91 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  30.21 
 
 		 395 aa  89.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  36.42 
 
 		 460 aa  82.4  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.1 
 
 		 1882 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  30 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  25.74 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  30.41 
 
 		 1518 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  28.57 
 
 		 2392 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  27.43 
 
 		 1732 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1052 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  28.19 
 
 		 730 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  28.74 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  28.83 
 
 		 1842 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1247 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  28.19 
 
 		 476 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  30.49 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3983  hypothetical protein  28.47 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  25.6 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.2 
 
 		 2495 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  37.31 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  23.12 
 
 		 2031 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  25.74 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>