34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2152 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  100 
 
 		 1362 aa  2628    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  42.29 
 
 		 2848 aa  549  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  39.94 
 
 		 1480 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.53 
 
 		 3477 aa  268  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.89 
 
 		 3544 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  34.12 
 
 		 2522 aa  253  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.61 
 
 		 3699 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  34.83 
 
 		 1911 aa  251  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  36.11 
 
 		 3699 aa  251  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.64 
 
 		 3089 aa  251  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  34.43 
 
 		 2503 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.43 
 
 		 2839 aa  248  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.39 
 
 		 2476 aa  243  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 2153 aa  221  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.63 
 
 		 3816 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  31.63 
 
 		 2715 aa  218  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  29.27 
 
 		 2670 aa  174  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.23 
 
 		 3278 aa  154  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  41.7 
 
 		 823 aa  112  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  29.31 
 
 		 2074 aa  85.5  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.9 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  32.31 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  28.64 
 
 		 722 aa  71.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  35.87 
 
 		 14609 aa  68.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  48.91 
 
 		 483 aa  67  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  39.6 
 
 		 852 aa  60.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 		 1755 aa  59.3  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  41.41 
 
 		 972 aa  55.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  30.09 
 
 		 440 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 1264 aa  50.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1908 aa  48.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  40.45 
 
 		 3861 aa  47.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1987 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  64.29 
 
 		 772 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>