24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0709 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0709  hypothetical protein  100 
 
 		 733 aa  1512    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247349  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  34.79 
 
 		 1004 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2456  secreted metalloprotease  33.8 
 
 		 543 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.055863 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  29.36 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.54 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  31.65 
 
 		 885 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0603  M6 family metalloprotease domain protein  28.22 
 
 		 1024 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.460158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1406 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1825 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  26.53 
 
 		 1096 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  26.29 
 
 		 1028 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  26.58 
 
 		 480 aa  99  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  26.84 
 
 		 735 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  24.81 
 
 		 778 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1076 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  25.91 
 
 		 998 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  23.7 
 
 		 994 aa  71.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49918  predicted protein  29.39 
 
 		 652 aa  70.1  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40744  predicted protein  26.18 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.88 
 
 		 1295 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.89 
 
 		 1748 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  29.33 
 
 		 1160 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  26.95 
 
 		 945 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.21 
 
 		 669 aa  45.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>