17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0451 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 1152 aa  2354    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  38 
 
 		 1123 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  33.96 
 
 		 295 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  34.47 
 
 		 591 aa  80.1  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  32.35 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  34.52 
 
 		 317 aa  66.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.12 
 
 		 746 aa  64.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  28.78 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 480 aa  53.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03097  putative Fimh-like protein  37.66 
 
 		 187 aa  52.4  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  28.66 
 
 		 477 aa  49.7  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1791  protein of unknown function DUF1566  36.84 
 
 		 343 aa  49.7  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  29.63 
 
 		 380 aa  48.9  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0168  protein of unknown function DUF1566  38.6 
 
 		 333 aa  46.2  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1571  hypothetical protein  30.69 
 
 		 309 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00368675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3265  hypothetical protein  32.17 
 
 		 245 aa  45.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3291  hypothetical protein  33.77 
 
 		 165 aa  44.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>