27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4277 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4277  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 690 aa  1348    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  40.09 
 
 		 1504 aa  99.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0942  hypothetical protein  61.43 
 
 		 123 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0665819  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  42.5 
 
 		 1532 aa  74.3  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  44.86 
 
 		 2042 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  32.76 
 
 		 1417 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  30.73 
 
 		 1418 aa  54.7  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  28.98 
 
 		 1746 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  35.85 
 
 		 1417 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  31.38 
 
 		 2358 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  31.38 
 
 		 2296 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  31.38 
 
 		 2367 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  31.38 
 
 		 2383 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  32.28 
 
 		 2620 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  33.14 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  33.14 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  32.65 
 
 		 1237 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  31.38 
 
 		 2358 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  35.58 
 
 		 1417 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  30.29 
 
 		 2933 aa  47.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  33.15 
 
 		 835 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  33.33 
 
 		 1396 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.82 
 
 		 1224 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.52 
 
 		 878 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  27.04 
 
 		 1224 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.82 
 
 		 1224 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  53.19 
 
 		 1895 aa  44.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>