More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0361 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
958 aa  1966    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  38.48 
 
 
990 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  34.98 
 
 
937 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  36.84 
 
 
957 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  29.71 
 
 
560 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 
543 aa  161  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 
551 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  25.83 
 
 
552 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 
593 aa  147  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  24.79 
 
 
552 aa  144  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 
554 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  25.91 
 
 
624 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  25.55 
 
 
590 aa  124  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  24.96 
 
 
607 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  24.2 
 
 
541 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  27.19 
 
 
592 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.67 
 
 
623 aa  118  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  22.95 
 
 
637 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  33.52 
 
 
630 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.5 
 
 
638 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 
614 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.09 
 
 
561 aa  115  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  28.32 
 
 
594 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.29 
 
 
606 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  31.16 
 
 
606 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.07 
 
 
594 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.51 
 
 
594 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.51 
 
 
581 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.52 
 
 
594 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.52 
 
 
594 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.52 
 
 
594 aa  111  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.09 
 
 
587 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.21 
 
 
604 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.47 
 
 
642 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.57 
 
 
600 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.86 
 
 
610 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.62 
 
 
610 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  25.35 
 
 
745 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.79 
 
 
612 aa  109  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  28.51 
 
 
589 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  35.18 
 
 
592 aa  108  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.25 
 
 
592 aa  107  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  27.64 
 
 
625 aa  107  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.46 
 
 
592 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  28.11 
 
 
600 aa  107  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  26.01 
 
 
593 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.98 
 
 
592 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.27 
 
 
587 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.33 
 
 
605 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.42 
 
 
608 aa  106  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1971  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.36 
 
 
587 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.464532  hitchhiker  0.0000864181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24 
 
 
577 aa  105  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.03 
 
 
636 aa  105  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  25.68 
 
 
595 aa  104  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.11 
 
 
586 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.12 
 
 
601 aa  104  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.32 
 
 
618 aa  104  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.77 
 
 
621 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.77 
 
 
621 aa  104  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  28.57 
 
 
604 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16640  maltooligosyl trehalose hydrolase  31.43 
 
 
633 aa  103  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189184  normal  0.0825424 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.66 
 
 
613 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.93 
 
 
653 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.32 
 
 
614 aa  103  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.66 
 
 
613 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.09 
 
 
583 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  32.63 
 
 
622 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.29 
 
 
596 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.62 
 
 
589 aa  102  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.9 
 
 
553 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.79 
 
 
587 aa  102  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 
606 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.08 
 
 
672 aa  100  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.59 
 
 
587 aa  100  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.95 
 
 
611 aa  100  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.88 
 
 
607 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  28.36 
 
 
583 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 
583 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  26.15 
 
 
876 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  30.13 
 
 
640 aa  99.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.28 
 
 
626 aa  99.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.37 
 
 
618 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.94 
 
 
587 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  29.37 
 
 
618 aa  99  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.48 
 
 
499 aa  99  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.76 
 
 
605 aa  98.6  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  23.6 
 
 
748 aa  98.6  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.18 
 
 
594 aa  98.6  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.63 
 
 
626 aa  98.6  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.75 
 
 
580 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.33 
 
 
607 aa  98.6  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.89 
 
 
593 aa  98.6  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.23 
 
 
613 aa  98.2  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  27.24 
 
 
615 aa  97.8  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0540  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.43 
 
 
603 aa  97.8  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.88 
 
 
588 aa  97.8  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.22 
 
 
601 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  26.78 
 
 
604 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  29.17 
 
 
731 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.09 
 
 
584 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>