More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1279 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
560 aa  1154    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  35.93 
 
 
552 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  36.28 
 
 
551 aa  302  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  33.81 
 
 
552 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  31.79 
 
 
543 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  33.09 
 
 
541 aa  267  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  31.24 
 
 
554 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 
593 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  33.33 
 
 
607 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  29.71 
 
 
958 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.89 
 
 
637 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  33.6 
 
 
754 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.92 
 
 
623 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  28.08 
 
 
990 aa  200  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  27.69 
 
 
937 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  34.48 
 
 
745 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.71 
 
 
610 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  30.23 
 
 
590 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.03 
 
 
608 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.62 
 
 
653 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  27.68 
 
 
648 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  31.96 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.59 
 
 
618 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
606 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.78 
 
 
621 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 
614 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  27.78 
 
 
624 aa  171  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.07 
 
 
614 aa  170  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.45 
 
 
604 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.27 
 
 
577 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.64 
 
 
587 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.68 
 
 
587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  31.8 
 
 
592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  30.67 
 
 
606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  24.73 
 
 
957 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.79 
 
 
561 aa  162  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.41 
 
 
581 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.69 
 
 
584 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.75 
 
 
587 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.51 
 
 
592 aa  161  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.91 
 
 
601 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.78 
 
 
588 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.38 
 
 
636 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.59 
 
 
605 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.68 
 
 
605 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 
818 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.09 
 
 
601 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  35.46 
 
 
600 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.49 
 
 
601 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 
876 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.49 
 
 
601 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.4 
 
 
607 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  29.71 
 
 
630 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.75 
 
 
601 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  31.41 
 
 
640 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.09 
 
 
592 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.33 
 
 
586 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  30.66 
 
 
583 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.96 
 
 
600 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.96 
 
 
618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0540  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.99 
 
 
603 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  32.96 
 
 
618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  27.87 
 
 
592 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30 
 
 
612 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.67 
 
 
587 aa  154  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.42 
 
 
613 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.04 
 
 
640 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.95 
 
 
640 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.89 
 
 
642 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.64 
 
 
610 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31 
 
 
583 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  28.47 
 
 
594 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.82 
 
 
611 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.8 
 
 
592 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.12 
 
 
605 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.18 
 
 
596 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.61 
 
 
606 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  28.86 
 
 
589 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.57 
 
 
580 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.19 
 
 
584 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.57 
 
 
634 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  34.57 
 
 
580 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  34.57 
 
 
580 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  34.57 
 
 
580 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  34.57 
 
 
580 aa  150  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  36.68 
 
 
615 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.03 
 
 
603 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.32 
 
 
629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.39 
 
 
621 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  27.46 
 
 
742 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.89 
 
 
594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.25 
 
 
594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.25 
 
 
594 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  25.88 
 
 
680 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  36.69 
 
 
604 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.03 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.34 
 
 
580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.86 
 
 
594 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.25 
 
 
594 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.12 
 
 
629 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>