More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2993 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4051  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  62.46 
 
 
580 aa  730    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10082  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05186  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase protein  59.69 
 
 
622 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256787  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1792  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  62.22 
 
 
580 aa  726    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  89.74 
 
 
604 aa  1099    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
604 aa  1238    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  63.2 
 
 
580 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  68.77 
 
 
600 aa  841    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  59.51 
 
 
583 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  60.5 
 
 
613 aa  653    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  56.56 
 
 
636 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  57.63 
 
 
640 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  60.5 
 
 
613 aa  653    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  59.22 
 
 
584 aa  687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  58.4 
 
 
601 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  58.22 
 
 
583 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3650  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  62.52 
 
 
580 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.736771  normal  0.277493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  56.9 
 
 
598 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.53 
 
 
640 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.32 
 
 
623 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.49 
 
 
623 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  55.19 
 
 
572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  56.63 
 
 
623 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  56.29 
 
 
623 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.51 
 
 
619 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  56.29 
 
 
623 aa  595  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  52.84 
 
 
629 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  50.64 
 
 
687 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7030  glycoside hydrolase family protein  56.29 
 
 
623 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0292632  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.66 
 
 
634 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  54.95 
 
 
553 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.66 
 
 
634 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  57.66 
 
 
634 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  50.75 
 
 
606 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  54.38 
 
 
604 aa  540  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  49.58 
 
 
592 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  51.05 
 
 
625 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  61.49 
 
 
580 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  61.49 
 
 
580 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  61.49 
 
 
580 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  61.49 
 
 
580 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.86 
 
 
592 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.79 
 
 
587 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  50.34 
 
 
592 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.62 
 
 
587 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.54 
 
 
601 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.71 
 
 
601 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.37 
 
 
601 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.38 
 
 
606 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  49.41 
 
 
592 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1601  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  51.13 
 
 
601 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  47.19 
 
 
615 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.49 
 
 
603 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  50.62 
 
 
594 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  50.18 
 
 
618 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.18 
 
 
618 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.27 
 
 
588 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  48.92 
 
 
589 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  48.28 
 
 
607 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50.19 
 
 
587 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6810  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  54.02 
 
 
605 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368114  normal  0.56457 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  47.59 
 
 
587 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  50 
 
 
611 aa  468  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.17 
 
 
594 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.17 
 
 
594 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.17 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45 
 
 
594 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  46.38 
 
 
587 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.48 
 
 
594 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.57 
 
 
601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.66 
 
 
596 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.05 
 
 
586 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.33 
 
 
638 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.62 
 
 
607 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.15 
 
 
618 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  45.19 
 
 
592 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.87 
 
 
605 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0540  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.48 
 
 
603 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.96 
 
 
605 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.78 
 
 
608 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.97 
 
 
626 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  43.24 
 
 
621 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  42.8 
 
 
614 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.91 
 
 
626 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.02 
 
 
629 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.06 
 
 
613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  37.02 
 
 
629 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.34 
 
 
621 aa  356  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.81 
 
 
672 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  37.19 
 
 
606 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.9 
 
 
612 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.83 
 
 
581 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0037  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.15 
 
 
614 aa  345  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3716  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  39.07 
 
 
636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.44 
 
 
642 aa  343  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3664  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.7 
 
 
659 aa  343  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186742  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  40.71 
 
 
630 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3802  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  40.66 
 
 
590 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300682  normal  0.0163414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  41.79 
 
 
554 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3733  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  44.42 
 
 
554 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3773  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  38.87 
 
 
639 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>