More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5428 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 614 aa  1272    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  25.69 
 
 		 624 aa  193  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.35 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  26.33 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 		 551 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  27.24 
 
 		 552 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 552 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 958 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  24.96 
 
 		 593 aa  113  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 		 990 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  31.03 
 
 		 776 aa  107  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  24.95 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  26.59 
 
 		 590 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  21.96 
 
 		 937 aa  101  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  29.44 
 
 		 1252 aa  99.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  25.35 
 
 		 852 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  25.35 
 
 		 852 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  24.81 
 
 		 856 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  25.17 
 
 		 852 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  25.17 
 
 		 850 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  24.91 
 
 		 852 aa  97.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  20.5 
 
 		 608 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  25.17 
 
 		 848 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  24.39 
 
 		 874 aa  95.9  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  25.31 
 
 		 637 aa  95.5  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  22.98 
 
 		 928 aa  95.1  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  22.9 
 
 		 842 aa  94.4  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  22.35 
 
 		 843 aa  94  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  23.75 
 
 		 841 aa  93.6  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.52 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  22.29 
 
 		 843 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  24.15 
 
 		 640 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  26.65 
 
 		 601 aa  92.4  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.93 
 
 		 581 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.93 
 
 		 2638 aa  91.3  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.25 
 
 		 623 aa  90.9  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  24.43 
 
 		 852 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  23.4 
 
 		 899 aa  90.9  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.7 
 
 		 587 aa  90.5  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  22.64 
 
 		 1043 aa  90.5  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  24.24 
 
 		 713 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.08 
 
 		 610 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.96 
 
 		 589 aa  89  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  24.62 
 
 		 713 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  24.03 
 
 		 713 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.29 
 
 		 579 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  24.42 
 
 		 852 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  24.46 
 
 		 713 aa  87.4  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  24.17 
 
 		 848 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  24.62 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  24.24 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  24.24 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.21 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.27 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.27 
 
 		 604 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  28.57 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  29.27 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  29.11 
 
 		 693 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  24.35 
 
 		 713 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  28.57 
 
 		 708 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.95 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.21 
 
 		 594 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.91 
 
 		 630 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.35 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  30.77 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0369  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 		 659 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.59 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  23.23 
 
 		 713 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  30.52 
 
 		 720 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.31 
 
 		 586 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  24.24 
 
 		 713 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3733  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.21 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.01 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3082  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.09 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.79708  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  35.09 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal  0.16328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.73 
 
 		 584 aa  80.5  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.72 
 
 		 596 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  32.32 
 
 		 701 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.27 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  23.63 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.05 
 
 		 621 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.24 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  30.17 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11594  maltooligosyltrehalose trehalohydrolase treZ  30.99 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024442  normal  0.83191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  23.77 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0888  glycogen operon protein  26.76 
 
 		 660 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.46 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1844  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.71 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.521996  normal  0.198003 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  30.65 
 
 		 765 aa  79  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  28.92 
 
 		 714 aa  78.6  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  24.49 
 
 		 721 aa  79  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  26.79 
 
 		 712 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3099  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  34.5 
 
 		 578 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.42888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0100  alpha amylase catalytic region  23.72 
 
 		 802 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  29.33 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  22.31 
 
 		 825 aa  78.2  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>