More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1790 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  100 
 
 
624 aa  1297    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  25.69 
 
 
614 aa  193  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 
560 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 
958 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.29 
 
 
637 aa  127  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  23.98 
 
 
990 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  27.4 
 
 
937 aa  124  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 
541 aa  124  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
552 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  25.19 
 
 
551 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  24.4 
 
 
554 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  23.57 
 
 
552 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  23.89 
 
 
543 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
593 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  30.92 
 
 
957 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  26.63 
 
 
592 aa  101  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  24.62 
 
 
625 aa  100  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  24.62 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  23.8 
 
 
607 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.05 
 
 
587 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.7 
 
 
672 aa  95.5  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.25 
 
 
605 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.25 
 
 
605 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.5 
 
 
600 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.34 
 
 
606 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.63 
 
 
610 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.58 
 
 
610 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  22.48 
 
 
630 aa  91.3  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  26.19 
 
 
754 aa  90.5  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.52 
 
 
623 aa  90.5  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.07 
 
 
587 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  22.16 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.26 
 
 
594 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.47 
 
 
561 aa  87.4  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.13 
 
 
581 aa  87  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2832  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25 
 
 
601 aa  87  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.89 
 
 
609 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  22.27 
 
 
928 aa  85.9  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7549  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.96 
 
 
603 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2989  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.93 
 
 
574 aa  85.5  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.92 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.14 
 
 
586 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2710  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.36 
 
 
601 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  0.0573085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.19 
 
 
593 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1971  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.51 
 
 
587 aa  84  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.464532  hitchhiker  0.0000864181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.86 
 
 
601 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1681  Alpha amylase  29.45 
 
 
615 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  28.93 
 
 
600 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.53 
 
 
589 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.53 
 
 
612 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.28 
 
 
588 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.13 
 
 
621 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  29.55 
 
 
589 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  28.24 
 
 
827 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.38 
 
 
614 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  28.32 
 
 
771 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.68 
 
 
592 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  29.05 
 
 
594 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.41 
 
 
587 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.27 
 
 
732 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.23 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.14 
 
 
587 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.82 
 
 
604 aa  82  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.23 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.42 
 
 
618 aa  80.9  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  20.78 
 
 
606 aa  80.9  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  28.57 
 
 
606 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30 
 
 
618 aa  80.9  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.23 
 
 
613 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  24.38 
 
 
583 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  27.42 
 
 
618 aa  80.9  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  32.39 
 
 
730 aa  80.9  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.94 
 
 
659 aa  80.9  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  23.59 
 
 
727 aa  80.9  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11594  maltooligosyltrehalose trehalohydrolase treZ  26.78 
 
 
580 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0024442  normal  0.83191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  26.69 
 
 
745 aa  80.5  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  23.17 
 
 
574 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  25.57 
 
 
746 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1823  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.55 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597034  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.88 
 
 
761 aa  80.1  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.99 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.640878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.14 
 
 
613 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.09 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.49 
 
 
587 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 
564 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  31.94 
 
 
739 aa  79.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  23.87 
 
 
595 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.57 
 
 
608 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.28 
 
 
626 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  25.09 
 
 
559 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  29.12 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  19.01 
 
 
715 aa  78.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.21 
 
 
636 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.37 
 
 
642 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 
818 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  25.26 
 
 
601 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  29.21 
 
 
738 aa  78.2  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>