More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4273 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  68.73 
 
 
551 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
543 aa  1131    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  64.97 
 
 
552 aa  772    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  66.06 
 
 
552 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  56.47 
 
 
554 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  40.53 
 
 
541 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  31.79 
 
 
560 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 
593 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.87 
 
 
607 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.55 
 
 
623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 
958 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  27.53 
 
 
990 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  25.77 
 
 
637 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  25.72 
 
 
590 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  26.73 
 
 
957 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.17 
 
 
610 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  26.71 
 
 
754 aa  145  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.91 
 
 
608 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.04 
 
 
614 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  25.74 
 
 
827 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.11 
 
 
605 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.04 
 
 
587 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.53 
 
 
621 aa  137  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  26.34 
 
 
818 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.77 
 
 
605 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.1 
 
 
587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.92 
 
 
577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  24.78 
 
 
876 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  23.71 
 
 
653 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.84 
 
 
629 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.82 
 
 
630 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.8 
 
 
594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.24 
 
 
642 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.68 
 
 
594 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.68 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.8 
 
 
610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.62 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.49 
 
 
594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.93 
 
 
623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.15 
 
 
623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.15 
 
 
623 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.08 
 
 
561 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.64 
 
 
618 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.51 
 
 
594 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 
606 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  27.06 
 
 
640 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  25.05 
 
 
625 aa  126  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2989  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.57 
 
 
574 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  24.36 
 
 
730 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.46 
 
 
584 aa  126  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  25.22 
 
 
606 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.2 
 
 
587 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5428  alpha amylase catalytic region  25.27 
 
 
614 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.76 
 
 
640 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.45 
 
 
601 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.48 
 
 
586 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  23.52 
 
 
648 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  25.8 
 
 
850 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  25.66 
 
 
852 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  25.61 
 
 
852 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  25.61 
 
 
852 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1280  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.09 
 
 
599 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.38 
 
 
626 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.59 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.33 
 
 
606 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  24.21 
 
 
729 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  25.8 
 
 
852 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.06 
 
 
572 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  25.8 
 
 
583 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2616  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.31 
 
 
589 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.57 
 
 
621 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.25 
 
 
593 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  25.61 
 
 
848 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4233  alpha amylase domain-containing protein  24.22 
 
 
687 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.24 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28 
 
 
600 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1952  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.08 
 
 
584 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.06 
 
 
619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.09 
 
 
640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.89 
 
 
634 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  26.89 
 
 
580 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4167  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.2 
 
 
588 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.423754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  26.89 
 
 
580 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.76 
 
 
636 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  26.89 
 
 
580 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  26.89 
 
 
580 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  27.03 
 
 
630 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  25.32 
 
 
729 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2907  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  22.66 
 
 
584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3633  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.14 
 
 
577 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  25 
 
 
1064 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  32.97 
 
 
937 aa  117  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  35.57 
 
 
854 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  25 
 
 
1064 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.67 
 
 
598 aa  116  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.94 
 
 
583 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  23.93 
 
 
600 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.56 
 
 
623 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.67 
 
 
586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.34 
 
 
623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>