More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0413 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 		 637 aa  1320    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  55.26 
 
 		 593 aa  691    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.8 
 
 		 607 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  43.88 
 
 		 590 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.37 
 
 		 623 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  30.83 
 
 		 648 aa  231  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.45 
 
 		 653 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  30.89 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.08 
 
 		 721 aa  216  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.09 
 
 		 731 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  30.55 
 
 		 748 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.21 
 
 		 631 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  31.17 
 
 		 768 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  31.17 
 
 		 768 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  28.91 
 
 		 876 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  29.25 
 
 		 730 aa  206  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 740 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.14 
 
 		 784 aa  205  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  28.59 
 
 		 748 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.14 
 
 		 784 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.5 
 
 		 785 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  29.59 
 
 		 729 aa  204  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.41 
 
 		 731 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  30.85 
 
 		 695 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  28.07 
 
 		 731 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  28.23 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  30 
 
 		 736 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  29.47 
 
 		 742 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  31.01 
 
 		 643 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  30.59 
 
 		 638 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  29.68 
 
 		 735 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  29.25 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.38 
 
 		 741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  29.42 
 
 		 834 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  30.15 
 
 		 642 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  29.28 
 
 		 638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  30.89 
 
 		 729 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  29.35 
 
 		 735 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.04 
 
 		 650 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  28.67 
 
 		 749 aa  196  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.25 
 
 		 659 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.25 
 
 		 659 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.93 
 
 		 736 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  30.37 
 
 		 740 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.1 
 
 		 739 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.21 
 
 		 736 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  29.07 
 
 		 727 aa  196  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  29.4 
 
 		 728 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.92 
 
 		 659 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  29.68 
 
 		 750 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  29.48 
 
 		 640 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  30.12 
 
 		 775 aa  194  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  29.25 
 
 		 736 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  30.22 
 
 		 1224 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.41 
 
 		 743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.39 
 
 		 747 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  28.53 
 
 		 749 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  28.62 
 
 		 743 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  28.98 
 
 		 728 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  28.62 
 
 		 743 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.85 
 
 		 760 aa  191  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 727 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 727 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  29.02 
 
 		 725 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  28.95 
 
 		 727 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.59 
 
 		 761 aa  190  8e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  28.43 
 
 		 785 aa  190  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  28.45 
 
 		 743 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.96 
 
 		 732 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  28.07 
 
 		 725 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  28.41 
 
 		 749 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.61 
 
 		 635 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.87 
 
 		 735 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  29.2 
 
 		 737 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.84 
 
 		 654 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  30.02 
 
 		 634 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  30.41 
 
 		 1240 aa  189  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.87 
 
 		 732 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.64 
 
 		 732 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  28.28 
 
 		 743 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  30.43 
 
 		 736 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.9 
 
 		 770 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  29.75 
 
 		 755 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.79 
 
 		 621 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.03 
 
 		 768 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.75 
 
 		 1217 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  31.35 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  29.85 
 
 		 736 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.01 
 
 		 646 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  30.23 
 
 		 732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.81 
 
 		 726 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  27.95 
 
 		 645 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  28.91 
 
 		 755 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  29.55 
 
 		 1320 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  30.05 
 
 		 732 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.41 
 
 		 674 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  29.95 
 
 		 736 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  28.67 
 
 		 771 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  27.46 
 
 		 645 aa  184  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.02 
 
 		 586 aa  183  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>