More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0818 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  47.17 
 
 
754 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  51.15 
 
 
645 aa  684    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.25 
 
 
732 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  49.61 
 
 
736 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  50.97 
 
 
645 aa  690    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  51.09 
 
 
740 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  51.15 
 
 
645 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  50.3 
 
 
645 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.97 
 
 
668 aa  648    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  51.46 
 
 
766 aa  703    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.76 
 
 
731 aa  652    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  51 
 
 
645 aa  683    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  50.69 
 
 
645 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  50.84 
 
 
637 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  65.19 
 
 
626 aa  849    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.14 
 
 
635 aa  654    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  51.38 
 
 
763 aa  696    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  48 
 
 
755 aa  644    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  48.77 
 
 
759 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  49.68 
 
 
728 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  51.1 
 
 
740 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.81 
 
 
650 aa  723    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  47.17 
 
 
754 aa  648    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  51.53 
 
 
764 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  50.69 
 
 
645 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  53.89 
 
 
749 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.73 
 
 
737 aa  766    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.64 
 
 
629 aa  643    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  52.21 
 
 
648 aa  682    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  49.68 
 
 
728 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.17 
 
 
742 aa  742    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 
764 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  48.99 
 
 
765 aa  648    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 
638 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  51.26 
 
 
726 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  51 
 
 
645 aa  683    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  47.32 
 
 
754 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  52.91 
 
 
774 aa  714    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  53.02 
 
 
746 aa  673    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.47 
 
 
726 aa  648    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  52.07 
 
 
782 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  51.1 
 
 
740 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  49.14 
 
 
736 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  48.68 
 
 
756 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.61 
 
 
638 aa  785    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  52.9 
 
 
725 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  51 
 
 
645 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  49.29 
 
 
736 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.17 
 
 
728 aa  712    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  51.72 
 
 
729 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  48.15 
 
 
755 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  51.18 
 
 
677 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  53.77 
 
 
725 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.16 
 
 
721 aa  649    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 
736 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  47.91 
 
 
754 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.25 
 
 
631 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.31 
 
 
659 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  50.69 
 
 
764 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  52.6 
 
 
722 aa  699    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.39 
 
 
1217 aa  666    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 
674 aa  1410    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 
784 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.39 
 
 
738 aa  670    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  52.5 
 
 
680 aa  707    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  49.61 
 
 
674 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  49.16 
 
 
776 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  52.07 
 
 
782 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.25 
 
 
735 aa  662    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 
695 aa  646    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  48.35 
 
 
785 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  49.53 
 
 
634 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.42 
 
 
631 aa  660    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  47.06 
 
 
1320 aa  640    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  51.81 
 
 
642 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  49.53 
 
 
642 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  51.34 
 
 
723 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  51.42 
 
 
728 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.76 
 
 
785 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  48.75 
 
 
727 aa  638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.31 
 
 
659 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.83 
 
 
630 aa  842    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.24 
 
 
784 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  47.77 
 
 
755 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  50.69 
 
 
645 aa  682    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  48.9 
 
 
735 aa  634  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.19 
 
 
739 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.07 
 
 
736 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.29 
 
 
659 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  49.21 
 
 
728 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.84 
 
 
654 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.28 
 
 
646 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.45 
 
 
639 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.28 
 
 
822 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  48.98 
 
 
625 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  47.26 
 
 
748 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  48.42 
 
 
632 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  48.98 
 
 
733 aa  629  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  47.81 
 
 
1240 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  48.19 
 
 
732 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>