More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0151 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  53.39 
 
 		 741 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.35 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  59.52 
 
 		 642 aa  770    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  52.3 
 
 		 748 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  53.91 
 
 		 736 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  50.4 
 
 		 765 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  56.66 
 
 		 740 aa  704    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  49.07 
 
 		 754 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  54.12 
 
 		 775 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  53.75 
 
 		 736 aa  674    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  51.67 
 
 		 728 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  50.71 
 
 		 746 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.23 
 
 		 741 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.36 
 
 		 728 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  59.14 
 
 		 634 aa  792    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  53.82 
 
 		 712 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  52.63 
 
 		 725 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  54.23 
 
 		 741 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  51.84 
 
 		 728 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  52.55 
 
 		 749 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  49.54 
 
 		 755 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  51.92 
 
 		 750 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  52.61 
 
 		 727 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  54.27 
 
 		 740 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  55.08 
 
 		 716 aa  680    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 738 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  50.15 
 
 		 764 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 738 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  56.57 
 
 		 749 aa  713    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  53.34 
 
 		 743 aa  667    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  54.88 
 
 		 728 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  51.58 
 
 		 735 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  47.93 
 
 		 764 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  49.3 
 
 		 765 aa  648    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  53.28 
 
 		 638 aa  663    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  53.55 
 
 		 726 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.96 
 
 		 721 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  49.07 
 
 		 754 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  51.07 
 
 		 774 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  53.11 
 
 		 746 aa  655    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  49.7 
 
 		 755 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  58.08 
 
 		 677 aa  750    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  49.54 
 
 		 763 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  54.92 
 
 		 740 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.47 
 
 		 737 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  53.03 
 
 		 834 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  52.15 
 
 		 812 aa  651    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  55.33 
 
 		 716 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.37 
 
 		 728 aa  730    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 638 aa  655    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  59.33 
 
 		 625 aa  759    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  56.36 
 
 		 729 aa  718    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  55.04 
 
 		 728 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  54.76 
 
 		 716 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  52.47 
 
 		 725 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  52.83 
 
 		 736 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  48.68 
 
 		 756 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  54.46 
 
 		 716 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  54.7 
 
 		 716 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.16 
 
 		 729 aa  675    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.68 
 
 		 1217 aa  756    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  50.87 
 
 		 736 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  52.29 
 
 		 727 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  55.5 
 
 		 722 aa  698    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6322  glycogen branching enzyme  52.52 
 
 		 733 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529539  normal  0.166008 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 738 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  48.02 
 
 		 754 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  55.02 
 
 		 738 aa  690    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  54.95 
 
 		 728 aa  683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  50.71 
 
 		 736 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.29 
 
 		 732 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  54.69 
 
 		 732 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.63 
 
 		 784 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  49.23 
 
 		 776 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 728 aa  651    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  53.75 
 
 		 736 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  52.7 
 
 		 695 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  53.91 
 
 		 736 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  52.05 
 
 		 733 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  54.53 
 
 		 732 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  52.63 
 
 		 755 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  53.67 
 
 		 1224 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  50.71 
 
 		 736 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.16 
 
 		 747 aa  676    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 754 aa  652    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  62.86 
 
 		 642 aa  824    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  55.01 
 
 		 723 aa  687    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 		 728 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.91 
 
 		 760 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  51.61 
 
 		 727 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  51.36 
 
 		 731 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  52.61 
 
 		 727 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.81 
 
 		 770 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.67 
 
 		 732 aa  672    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  49.39 
 
 		 759 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.27 
 
 		 631 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>