More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2285 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  53.8 
 
 		 759 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  51.93 
 
 		 634 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  53.97 
 
 		 728 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  52.7 
 
 		 736 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.09 
 
 		 626 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  57.32 
 
 		 740 aa  733    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  53.22 
 
 		 775 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.35 
 
 		 732 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  52.64 
 
 		 728 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  72.93 
 
 		 643 aa  969    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.91 
 
 		 741 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.31 
 
 		 784 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 		 736 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.44 
 
 		 732 aa  683    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  52.54 
 
 		 736 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.04 
 
 		 739 aa  642    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  53.43 
 
 		 741 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  56.68 
 
 		 621 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  54.15 
 
 		 749 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 755 aa  649    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.35 
 
 		 732 aa  694    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.72 
 
 		 737 aa  692    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  59.87 
 
 		 740 aa  748    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.35 
 
 		 735 aa  695    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  53.15 
 
 		 736 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  57.01 
 
 		 748 aa  714    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  52.01 
 
 		 764 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.21 
 
 		 728 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  56.37 
 
 		 749 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  54.46 
 
 		 743 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  48.44 
 
 		 754 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  53.97 
 
 		 728 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  54.34 
 
 		 735 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  50.54 
 
 		 782 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  49.92 
 
 		 765 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 755 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 638 aa  1320    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  56.29 
 
 		 726 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  52.54 
 
 		 736 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 754 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  51.85 
 
 		 774 aa  663    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  55.84 
 
 		 746 aa  702    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 736 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  51.85 
 
 		 763 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  56.39 
 
 		 740 aa  702    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  54.43 
 
 		 677 aa  683    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  55.69 
 
 		 834 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  51.92 
 
 		 712 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  55.91 
 
 		 812 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  55.77 
 
 		 755 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  54.1 
 
 		 721 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  52.96 
 
 		 728 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  53.14 
 
 		 729 aa  669    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  57.23 
 
 		 725 aa  707    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  52.1 
 
 		 737 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  51.81 
 
 		 728 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.52 
 
 		 747 aa  637    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  55.7 
 
 		 731 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  52.96 
 
 		 728 aa  646    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  53.48 
 
 		 759 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  56.03 
 
 		 722 aa  689    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  53.01 
 
 		 741 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  53.28 
 
 		 728 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  55.24 
 
 		 738 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  53.49 
 
 		 728 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  52.96 
 
 		 728 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  54.95 
 
 		 732 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 728 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  53.65 
 
 		 768 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  50.77 
 
 		 776 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  53.65 
 
 		 727 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.84 
 
 		 638 aa  645    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  58.54 
 
 		 695 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.84 
 
 		 631 aa  702    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  51.16 
 
 		 766 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  55.27 
 
 		 732 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  52.96 
 
 		 728 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 1224 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.95 
 
 		 728 aa  712    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.14 
 
 		 784 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  53.93 
 
 		 642 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 723 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  54.57 
 
 		 728 aa  693    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.49 
 
 		 785 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  55.75 
 
 		 727 aa  696    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.2 
 
 		 760 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  53.26 
 
 		 749 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.17 
 
 		 770 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  53.48 
 
 		 759 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.81 
 
 		 1217 aa  666    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  53.09 
 
 		 737 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.51 
 
 		 631 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  72.87 
 
 		 640 aa  981    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  52.96 
 
 		 728 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>