More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6497 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  49.26 
 
 		 759 aa  662    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  51.97 
 
 		 728 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.97 
 
 		 728 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 		 712 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.97 
 
 		 729 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  57.57 
 
 		 736 aa  828    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  47 
 
 		 765 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 740 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  51.88 
 
 		 727 aa  728    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  61.25 
 
 		 775 aa  857    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  47.8 
 
 		 729 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  51.97 
 
 		 728 aa  756    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  49.86 
 
 		 746 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.88 
 
 		 741 aa  836    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  53.46 
 
 		 748 aa  707    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  56.84 
 
 		 712 aa  802    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  48.84 
 
 		 745 aa  695    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2936  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56 
 
 		 721 aa  751    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.19 
 
 		 732 aa  847    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  57.65 
 
 		 741 aa  831    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  48.51 
 
 		 743 aa  706    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.17 
 
 		 732 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  51.62 
 
 		 749 aa  699    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.37 
 
 		 784 aa  796    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  59.43 
 
 		 750 aa  823    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  56.07 
 
 		 728 aa  789    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  49.39 
 
 		 740 aa  660    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  51.23 
 
 		 716 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  46.84 
 
 		 764 aa  670    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1737  glycogen branching enzyme  77.67 
 
 		 738 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  49.39 
 
 		 749 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  57.87 
 
 		 743 aa  838    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  51.97 
 
 		 728 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  56.07 
 
 		 728 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  91.03 
 
 		 735 aa  1362    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  53.89 
 
 		 728 aa  759    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.06 
 
 		 728 aa  693    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  52.29 
 
 		 727 aa  732    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  47.76 
 
 		 726 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  49.68 
 
 		 634 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 742 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  46.68 
 
 		 774 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  48.14 
 
 		 746 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  56.05 
 
 		 728 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0536  1,4-alpha-glucan branching enzyme  83.93 
 
 		 448 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  55.12 
 
 		 677 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  53.54 
 
 		 740 aa  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.55 
 
 		 737 aa  714    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  56.44 
 
 		 834 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  51.24 
 
 		 642 aa  644    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  52.65 
 
 		 812 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  52.17 
 
 		 716 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  56.38 
 
 		 721 aa  763    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  56.26 
 
 		 638 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  52.7 
 
 		 755 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  51.8 
 
 		 729 aa  766    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  57.57 
 
 		 736 aa  829    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  52.34 
 
 		 716 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  46.71 
 
 		 763 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  65.66 
 
 		 736 aa  958    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  51.9 
 
 		 716 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  51.38 
 
 		 716 aa  700    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  54.31 
 
 		 725 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  58.12 
 
 		 732 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  99.86 
 
 		 736 aa  1483    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  48.99 
 
 		 759 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  55.98 
 
 		 722 aa  776    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1338  1,4-alpha-glucan branching enzyme  83.93 
 
 		 448 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  47.23 
 
 		 729 aa  653    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1543  glycogen branching enzyme  77.81 
 
 		 738 aa  1139    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.74 
 
 		 731 aa  644    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  55.37 
 
 		 738 aa  784    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 		 741 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  48.77 
 
 		 731 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  55.86 
 
 		 736 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  57.44 
 
 		 736 aa  826    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.59 
 
 		 807 aa  753    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  46.12 
 
 		 776 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  49.73 
 
 		 745 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  49.73 
 
 		 745 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  54.17 
 
 		 695 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  46.66 
 
 		 744 aa  678    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  88.32 
 
 		 733 aa  1330    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  58.06 
 
 		 732 aa  810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1566  glycogen branching enzyme  77.67 
 
 		 738 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  49.32 
 
 		 1224 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 736 aa  1484    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  48.78 
 
 		 743 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  52.37 
 
 		 642 aa  672    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  49.11 
 
 		 723 aa  678    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.86 
 
 		 728 aa  686    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  49.73 
 
 		 745 aa  712    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  51.78 
 
 		 727 aa  700    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 743 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  52.94 
 
 		 731 aa  736    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  51.5 
 
 		 749 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.16 
 
 		 841 aa  734    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  48.99 
 
 		 759 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  87.23 
 
 		 732 aa  1293    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  48.98 
 
 		 737 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>