More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2343 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 741 aa  1521    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  49.45 
 
 		 716 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  46.38 
 
 		 743 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  47.61 
 
 		 732 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.78 
 
 		 729 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.75 
 
 		 736 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  63.8 
 
 		 755 aa  894    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  48.44 
 
 		 740 aa  705    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  49.39 
 
 		 775 aa  649    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 712 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  48.44 
 
 		 768 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  46.31 
 
 		 746 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.9 
 
 		 741 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.15 
 
 		 785 aa  669    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  45.03 
 
 		 759 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  48.07 
 
 		 735 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  47.61 
 
 		 736 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  46.9 
 
 		 728 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 		 741 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  53.06 
 
 		 621 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  60.49 
 
 		 749 aa  906    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  44.41 
 
 		 755 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.38 
 
 		 728 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.88 
 
 		 737 aa  701    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  52.33 
 
 		 740 aa  715    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  48.42 
 
 		 716 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  47.45 
 
 		 727 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  46.6 
 
 		 764 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.34 
 
 		 736 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 749 aa  702    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  47.53 
 
 		 743 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  46.11 
 
 		 743 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  50.41 
 
 		 728 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  47.69 
 
 		 735 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  53.46 
 
 		 750 aa  791    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.19 
 
 		 631 aa  659    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  53.01 
 
 		 638 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  50.7 
 
 		 726 aa  728    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  49.19 
 
 		 736 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  43.67 
 
 		 754 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  45.95 
 
 		 774 aa  667    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 		 746 aa  691    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  47.93 
 
 		 712 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.41 
 
 		 755 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 740 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  47.76 
 
 		 732 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  49.79 
 
 		 834 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  43.67 
 
 		 754 aa  639    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  62.71 
 
 		 812 aa  904    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  46.7 
 
 		 745 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  50.34 
 
 		 716 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.18 
 
 		 730 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  47.42 
 
 		 763 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  51.28 
 
 		 625 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  47.32 
 
 		 729 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  49.31 
 
 		 716 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  49.79 
 
 		 725 aa  687    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  46.04 
 
 		 728 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  50.49 
 
 		 716 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48.29 
 
 		 736 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  49.66 
 
 		 716 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.24 
 
 		 784 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  48.51 
 
 		 736 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  83.17 
 
 		 759 aa  1270    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  51.03 
 
 		 722 aa  701    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.91 
 
 		 732 aa  841    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  83.31 
 
 		 759 aa  1272    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  50.07 
 
 		 725 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 738 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 728 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.62 
 
 		 732 aa  691    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  45.98 
 
 		 743 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  77.95 
 
 		 731 aa  1199    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.25 
 
 		 807 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  46.14 
 
 		 776 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.29 
 
 		 770 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  46.17 
 
 		 728 aa  636    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  54.07 
 
 		 695 aa  698    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  46.11 
 
 		 743 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  49.52 
 
 		 737 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  50.96 
 
 		 748 aa  696    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  47.88 
 
 		 732 aa  643    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  43.9 
 
 		 754 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  58.64 
 
 		 1224 aa  852    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  48.37 
 
 		 736 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  44.83 
 
 		 756 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  50.21 
 
 		 728 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.68 
 
 		 735 aa  713    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  47.16 
 
 		 723 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  48.57 
 
 		 728 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  47.45 
 
 		 727 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  61.06 
 
 		 727 aa  912    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  50.88 
 
 		 731 aa  709    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  56.34 
 
 		 749 aa  826    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.03 
 
 		 747 aa  651    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  83.17 
 
 		 759 aa  1270    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.93 
 
 		 1217 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  92.53 
 
 		 737 aa  1415    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 631 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  54.94 
 
 		 640 aa  668    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>