More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0999 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  54.91 
 
 		 759 aa  675    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  56.58 
 
 		 768 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  50.31 
 
 		 763 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  56.51 
 
 		 732 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  51.2 
 
 		 743 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  54.47 
 
 		 736 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.86 
 
 		 626 aa  647    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  54.46 
 
 		 740 aa  705    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  57.28 
 
 		 775 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  54.36 
 
 		 712 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  55.06 
 
 		 727 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  51.31 
 
 		 746 aa  658    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.06 
 
 		 741 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.04 
 
 		 729 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  54.31 
 
 		 736 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  51.41 
 
 		 634 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.62 
 
 		 1217 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  49.3 
 
 		 759 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  53.33 
 
 		 741 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  54.33 
 
 		 677 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  57.03 
 
 		 621 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  56.91 
 
 		 749 aa  679    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  48.62 
 
 		 755 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  56.34 
 
 		 750 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  48.46 
 
 		 755 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  59.13 
 
 		 740 aa  728    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  53.46 
 
 		 716 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.13 
 
 		 631 aa  697    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  50.39 
 
 		 764 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.91 
 
 		 728 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  56.42 
 
 		 749 aa  733    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  52.13 
 
 		 743 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.88 
 
 		 760 aa  664    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  56.54 
 
 		 728 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  53.51 
 
 		 736 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.89 
 
 		 638 aa  638    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 765 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  72.87 
 
 		 638 aa  964    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  56.84 
 
 		 726 aa  719    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  55.43 
 
 		 735 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.67 
 
 		 770 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  50.53 
 
 		 774 aa  670    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  57.41 
 
 		 746 aa  716    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.58 
 
 		 747 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  49.77 
 
 		 745 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  56.54 
 
 		 728 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  57.78 
 
 		 740 aa  708    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  54.05 
 
 		 642 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  58.12 
 
 		 834 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  54.41 
 
 		 712 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.03 
 
 		 735 aa  691    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  58.39 
 
 		 812 aa  707    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  54.57 
 
 		 716 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  53.98 
 
 		 721 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  53.44 
 
 		 638 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  54.4 
 
 		 625 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  55.32 
 
 		 729 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  53.55 
 
 		 716 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  57.1 
 
 		 725 aa  702    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.05 
 
 		 785 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  54.72 
 
 		 716 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  58.61 
 
 		 748 aa  723    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  54.19 
 
 		 716 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  51.2 
 
 		 743 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.13 
 
 		 728 aa  717    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  54.75 
 
 		 759 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  58.04 
 
 		 722 aa  714    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.91 
 
 		 732 aa  676    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  54.94 
 
 		 741 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  53.86 
 
 		 725 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  56.64 
 
 		 738 aa  698    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  56.15 
 
 		 728 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  55.23 
 
 		 736 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.54 
 
 		 732 aa  670    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  56.55 
 
 		 731 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  57.03 
 
 		 755 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  56.45 
 
 		 716 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  51.35 
 
 		 745 aa  647    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  51.51 
 
 		 745 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  59.27 
 
 		 695 aa  711    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.38 
 
 		 784 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  53.99 
 
 		 736 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  56.98 
 
 		 732 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  52.91 
 
 		 765 aa  665    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  54.79 
 
 		 1224 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  53.03 
 
 		 737 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  52.72 
 
 		 728 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  55.9 
 
 		 642 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.69 
 
 		 723 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  54.19 
 
 		 728 aa  687    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  51.67 
 
 		 745 aa  646    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  56.55 
 
 		 727 aa  703    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.22 
 
 		 737 aa  695    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  53.38 
 
 		 731 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  54.18 
 
 		 749 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.28 
 
 		 841 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  54.75 
 
 		 759 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  51.2 
 
 		 743 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  55.43 
 
 		 737 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.92 
 
 		 631 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>