More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0562 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.16 
 
 		 629 aa  655    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.23 
 
 		 630 aa  840    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.18 
 
 		 728 aa  696    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  55.63 
 
 		 645 aa  732    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 760 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  52.63 
 
 		 740 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  56.02 
 
 		 645 aa  727    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  55.63 
 
 		 645 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  51.77 
 
 		 634 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.76 
 
 		 650 aa  728    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  55.63 
 
 		 645 aa  730    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  55.79 
 
 		 645 aa  730    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  55.63 
 
 		 637 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  53.04 
 
 		 725 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.61 
 
 		 674 aa  785    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  50.79 
 
 		 632 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.03 
 
 		 659 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 770 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  51.68 
 
 		 740 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.69 
 
 		 726 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.64 
 
 		 784 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  52.07 
 
 		 764 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.56 
 
 		 749 aa  693    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.11 
 
 		 731 aa  696    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  48.17 
 
 		 728 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  52.77 
 
 		 782 aa  694    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  51.31 
 
 		 763 aa  692    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  48.7 
 
 		 765 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 638 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  51.28 
 
 		 726 aa  678    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  55.63 
 
 		 645 aa  730    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.24 
 
 		 633 aa  655    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  52.66 
 
 		 774 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  52.17 
 
 		 746 aa  669    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  48.48 
 
 		 728 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.36 
 
 		 737 aa  780    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  52.4 
 
 		 740 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.32 
 
 		 735 aa  681    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.92 
 
 		 668 aa  660    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  52.92 
 
 		 764 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 654 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.48 
 
 		 784 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  51.12 
 
 		 625 aa  651    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  53.5 
 
 		 729 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  55.79 
 
 		 645 aa  730    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.66 
 
 		 742 aa  731    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  52.72 
 
 		 725 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 748 aa  673    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  52 
 
 		 766 aa  695    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  53.81 
 
 		 648 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  49.45 
 
 		 730 aa  636    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  50.55 
 
 		 677 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  55.63 
 
 		 645 aa  732    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  52.4 
 
 		 722 aa  704    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.24 
 
 		 768 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.48 
 
 		 785 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  48.8 
 
 		 728 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.72 
 
 		 738 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  52.62 
 
 		 782 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  50.81 
 
 		 659 aa  671    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 		 674 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  49.61 
 
 		 659 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  56.27 
 
 		 645 aa  732    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  51.15 
 
 		 776 aa  678    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.17 
 
 		 631 aa  688    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.32 
 
 		 732 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  50.55 
 
 		 695 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  49.52 
 
 		 733 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 638 aa  1329    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.87 
 
 		 635 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.32 
 
 		 626 aa  797    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  58.1 
 
 		 680 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  51.59 
 
 		 642 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  53.28 
 
 		 723 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.21 
 
 		 728 aa  667    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.05 
 
 		 721 aa  636    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  56.43 
 
 		 645 aa  734    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.4 
 
 		 1217 aa  672    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.4 
 
 		 728 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.16 
 
 		 646 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.3 
 
 		 631 aa  685    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  48.89 
 
 		 640 aa  638    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  49.06 
 
 		 677 aa  641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.66 
 
 		 729 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.49 
 
 		 741 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  49.52 
 
 		 749 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.95 
 
 		 621 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.74 
 
 		 646 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.82 
 
 		 639 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.94 
 
 		 736 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.05 
 
 		 736 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 642 aa  630  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.94 
 
 		 736 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.76 
 
 		 739 aa  627  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  48.36 
 
 		 643 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.99 
 
 		 659 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.78 
 
 		 732 aa  628  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  49.03 
 
 		 737 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  46.96 
 
 		 731 aa  628  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  47.62 
 
 		 736 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>