More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1886 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.21 
 
 		 785 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.49 
 
 		 760 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.32 
 
 		 659 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  53 
 
 		 736 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  57.91 
 
 		 642 aa  680    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  53 
 
 		 736 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  58.2 
 
 		 632 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.84 
 
 		 741 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.46 
 
 		 633 aa  673    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.02 
 
 		 736 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 621 aa  1275    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  53.27 
 
 		 749 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.71 
 
 		 639 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  53.66 
 
 		 733 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.65 
 
 		 731 aa  652    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.7 
 
 		 668 aa  656    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.4 
 
 		 749 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  54.41 
 
 		 785 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  55.59 
 
 		 728 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  57.82 
 
 		 677 aa  699    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  52.14 
 
 		 726 aa  638    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  53.48 
 
 		 731 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  49.85 
 
 		 766 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  52.52 
 
 		 774 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  55.75 
 
 		 728 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  57.08 
 
 		 677 aa  673    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  55.78 
 
 		 740 aa  676    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.35 
 
 		 1217 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  54.65 
 
 		 812 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.56 
 
 		 784 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.53 
 
 		 754 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  57.69 
 
 		 625 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  52.3 
 
 		 729 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.34 
 
 		 737 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.55 
 
 		 631 aa  703    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  56.21 
 
 		 722 aa  670    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.84 
 
 		 635 aa  684    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  54.4 
 
 		 738 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  55.66 
 
 		 728 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  52.84 
 
 		 736 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 634 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.77 
 
 		 646 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  53.75 
 
 		 725 aa  646    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.81 
 
 		 770 aa  651    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0363  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.21 
 
 		 637 aa  637    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.4 
 
 		 726 aa  658    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.72 
 
 		 784 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.03 
 
 		 822 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  57.95 
 
 		 642 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 		 727 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  51 
 
 		 763 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.47 
 
 		 728 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.09 
 
 		 631 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.72 
 
 		 746 aa  641    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  54.67 
 
 		 748 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.52 
 
 		 646 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  52.37 
 
 		 736 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  55.19 
 
 		 716 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  54.82 
 
 		 716 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.95 
 
 		 638 aa  634  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  53.16 
 
 		 737 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  50.95 
 
 		 740 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  52.38 
 
 		 735 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  51.61 
 
 		 764 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.57 
 
 		 768 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  53.24 
 
 		 725 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  49.61 
 
 		 764 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.59 
 
 		 630 aa  626  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.24 
 
 		 957 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  54.19 
 
 		 716 aa  628  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.86 
 
 		 743 aa  626  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  52.69 
 
 		 759 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.19 
 
 		 732 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  53.67 
 
 		 732 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.55 
 
 		 735 aa  624  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  53.33 
 
 		 750 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  53.3 
 
 		 716 aa  624  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  51.72 
 
 		 768 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  52.52 
 
 		 736 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  51.72 
 
 		 768 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  53.99 
 
 		 732 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  52.61 
 
 		 741 aa  623  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.62 
 
 		 734 aa  623  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.51 
 
 		 839 aa  625  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.55 
 
 		 732 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  53.32 
 
 		 727 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  52.64 
 
 		 749 aa  622  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.04 
 
 		 728 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  51.74 
 
 		 741 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  53.24 
 
 		 725 aa  618  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  53.54 
 
 		 716 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  51.92 
 
 		 746 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  51.74 
 
 		 748 aa  621  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  52.36 
 
 		 736 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  52.87 
 
 		 725 aa  618  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  53.24 
 
 		 716 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.92 
 
 		 743 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  51.11 
 
 		 1240 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  52.22 
 
 		 759 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.39 
 
 		 729 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>