More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3094 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  51.39 
 
 		 763 aa  675    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.85 
 
 		 739 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  51.69 
 
 		 764 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  60.41 
 
 		 634 aa  821    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.15 
 
 		 737 aa  699    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  50.63 
 
 		 736 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.96 
 
 		 626 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  50.8 
 
 		 740 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.69 
 
 		 659 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.71 
 
 		 631 aa  695    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  51.11 
 
 		 736 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  50.87 
 
 		 728 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  49.53 
 
 		 746 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  51.16 
 
 		 1240 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 745 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.99 
 
 		 768 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  50.63 
 
 		 736 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  53.33 
 
 		 725 aa  677    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.34 
 
 		 784 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  51.21 
 
 		 730 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  48.76 
 
 		 754 aa  650    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.54 
 
 		 654 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.99 
 
 		 785 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  49.54 
 
 		 755 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 736 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  50.47 
 
 		 743 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 740 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  51.04 
 
 		 716 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  51.44 
 
 		 716 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  50.46 
 
 		 764 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.45 
 
 		 728 aa  717    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.95 
 
 		 749 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  48.83 
 
 		 648 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  52.47 
 
 		 728 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  52.31 
 
 		 728 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.2 
 
 		 732 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 764 aa  659    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  50.46 
 
 		 765 aa  665    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.34 
 
 		 742 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  52.06 
 
 		 727 aa  649    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.75 
 
 		 723 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  49.07 
 
 		 754 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  52.23 
 
 		 774 aa  683    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  50.64 
 
 		 746 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  52.4 
 
 		 725 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  49.85 
 
 		 756 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  52.31 
 
 		 748 aa  654    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  53.82 
 
 		 740 aa  683    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  55.33 
 
 		 677 aa  702    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  49.45 
 
 		 768 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 755 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.82 
 
 		 770 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.46 
 
 		 631 aa  669    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  51.2 
 
 		 716 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.9 
 
 		 732 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  50.15 
 
 		 782 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  55.98 
 
 		 625 aa  693    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  53.1 
 
 		 729 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  59.9 
 
 		 677 aa  762    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  53.17 
 
 		 725 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.32 
 
 		 728 aa  654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  55.5 
 
 		 642 aa  714    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  51.59 
 
 		 716 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  52.41 
 
 		 727 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.11 
 
 		 729 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.97 
 
 		 731 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  54.81 
 
 		 632 aa  683    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  50.23 
 
 		 743 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  55.64 
 
 		 722 aa  715    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  49.45 
 
 		 768 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  48.75 
 
 		 754 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  51.27 
 
 		 725 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  52.88 
 
 		 738 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  51.19 
 
 		 728 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.96 
 
 		 732 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  51.99 
 
 		 732 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  51.18 
 
 		 728 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.9 
 
 		 735 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  49.24 
 
 		 776 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  49.52 
 
 		 745 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 745 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  51.04 
 
 		 695 aa  636    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 744 aa  652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.82 
 
 		 1217 aa  722    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  47.83 
 
 		 754 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  52.54 
 
 		 732 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.34 
 
 		 784 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  52.15 
 
 		 1224 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 759 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  53.05 
 
 		 640 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  58.51 
 
 		 642 aa  749    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  53.03 
 
 		 723 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 728 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 745 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  50.46 
 
 		 766 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  48.65 
 
 		 731 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.41 
 
 		 760 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.87 
 
 		 841 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 743 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  50.62 
 
 		 743 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>