More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3200 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.9 
 
 		 626 aa  705    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.15 
 
 		 737 aa  702    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.04 
 
 		 728 aa  660    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.21 
 
 		 674 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 648 aa  1343    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.81 
 
 		 638 aa  701    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  51.12 
 
 		 740 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  51.65 
 
 		 680 aa  668    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.83 
 
 		 646 aa  637    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  50.41 
 
 		 645 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.47 
 
 		 654 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.46 
 
 		 630 aa  692    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.1 
 
 		 650 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.23 
 
 		 742 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.72 
 
 		 731 aa  634  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  50.24 
 
 		 645 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  50.4 
 
 		 749 aa  633  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  50.57 
 
 		 645 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.16 
 
 		 631 aa  632  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 722 aa  634  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  47.77 
 
 		 674 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.94 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.94 
 
 		 659 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  49.92 
 
 		 645 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  51.2 
 
 		 725 aa  628  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  50.8 
 
 		 725 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 645 aa  631  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.28 
 
 		 668 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.32 
 
 		 738 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  48.39 
 
 		 766 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.32 
 
 		 631 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 645 aa  628  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 645 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 645 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  49.92 
 
 		 637 aa  628  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  48.46 
 
 		 764 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  51.12 
 
 		 746 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  48.48 
 
 		 729 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  47.33 
 
 		 659 aa  622  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.66 
 
 		 629 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.76 
 
 		 646 aa  622  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  48.77 
 
 		 774 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  48.8 
 
 		 740 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.93 
 
 		 670 aa  616  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  47.17 
 
 		 659 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  49.68 
 
 		 740 aa  609  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  47.69 
 
 		 763 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 659 aa  609  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 634 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  49.6 
 
 		 733 aa  611  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.94 
 
 		 635 aa  608  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.06 
 
 		 748 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  50.8 
 
 		 677 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  48.96 
 
 		 726 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.65 
 
 		 732 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  48.3 
 
 		 764 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  47.77 
 
 		 744 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  47.43 
 
 		 755 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  47.22 
 
 		 782 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  47.43 
 
 		 755 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  46.73 
 
 		 1320 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.56 
 
 		 784 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  48.01 
 
 		 728 aa  602  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.4 
 
 		 784 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  47.22 
 
 		 782 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.69 
 
 		 639 aa  601  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.44 
 
 		 1217 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  49.44 
 
 		 732 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.4 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 732 aa  596  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 642 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 735 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.12 
 
 		 723 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  46.76 
 
 		 776 aa  595  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  49.28 
 
 		 732 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.77 
 
 		 732 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 		 743 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 		 743 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 		 743 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 		 743 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  47.5 
 
 		 785 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 		 735 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.01 
 
 		 770 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48.57 
 
 		 736 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.78 
 
 		 743 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.75 
 
 		 760 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 723 aa  589  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  46.39 
 
 		 750 aa  586  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  48.41 
 
 		 736 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.59 
 
 		 736 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.41 
 
 		 736 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  47.13 
 
 		 764 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  47.13 
 
 		 765 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.91 
 
 		 741 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.48 
 
 		 732 aa  588  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.13 
 
 		 728 aa  586  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.52 
 
 		 726 aa  588  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>