More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1051 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1051  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 670 aa  1400    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.7 
 
 		 737 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.61 
 
 		 630 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 		 648 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.25 
 
 		 626 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.25 
 
 		 638 aa  608  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.27 
 
 		 674 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.82 
 
 		 650 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  46.52 
 
 		 749 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.63 
 
 		 646 aa  598  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.56 
 
 		 631 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  46.72 
 
 		 774 aa  588  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.5 
 
 		 728 aa  589  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  45.22 
 
 		 766 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  44.53 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  44.67 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  44.53 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  44.67 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.55 
 
 		 668 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  44.67 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  45.07 
 
 		 782 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  45.22 
 
 		 645 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  45.07 
 
 		 637 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  44.38 
 
 		 645 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  45.43 
 
 		 763 aa  578  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  44.53 
 
 		 645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  45.07 
 
 		 782 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  45.07 
 
 		 645 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  44.85 
 
 		 740 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.33 
 
 		 742 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  44.13 
 
 		 634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  45.71 
 
 		 722 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  45.9 
 
 		 723 aa  575  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  47.19 
 
 		 748 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.24 
 
 		 646 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  44.46 
 
 		 764 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  45.3 
 
 		 764 aa  569  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  45.45 
 
 		 764 aa  571  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  44.94 
 
 		 726 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  45.05 
 
 		 645 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  43.82 
 
 		 674 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  45.52 
 
 		 745 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  45.79 
 
 		 740 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  46.01 
 
 		 746 aa  567  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  45.07 
 
 		 776 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  45.52 
 
 		 745 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  45.54 
 
 		 677 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  45.52 
 
 		 745 aa  568  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  45.23 
 
 		 680 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.64 
 
 		 659 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  45.34 
 
 		 743 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  45.19 
 
 		 743 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  45.19 
 
 		 743 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  45.34 
 
 		 743 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  45.19 
 
 		 725 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  45.21 
 
 		 748 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.72 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  45.02 
 
 		 725 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.01 
 
 		 735 aa  558  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.67 
 
 		 755 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  44.82 
 
 		 755 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  45 
 
 		 765 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  44.76 
 
 		 746 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.7 
 
 		 636 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.17 
 
 		 732 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  44.63 
 
 		 756 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.5 
 
 		 1217 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.19 
 
 		 635 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.15 
 
 		 731 aa  556  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.68 
 
 		 736 aa  557  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  44.56 
 
 		 740 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.94 
 
 		 732 aa  558  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  44.63 
 
 		 754 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.07 
 
 		 743 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  44.09 
 
 		 759 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  45.15 
 
 		 745 aa  553  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  45.47 
 
 		 732 aa  552  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  46.78 
 
 		 625 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.12 
 
 		 654 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  44.31 
 
 		 754 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  43.59 
 
 		 659 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  43.77 
 
 		 1320 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  44.07 
 
 		 754 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  44.07 
 
 		 754 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  45.43 
 
 		 642 aa  551  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  44.5 
 
 		 738 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  43.88 
 
 		 728 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.31 
 
 		 639 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.54 
 
 		 736 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  42.99 
 
 		 729 aa  548  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  44.33 
 
 		 1224 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  44.66 
 
 		 642 aa  548  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  43.74 
 
 		 834 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.02 
 
 		 631 aa  543  1e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  43.12 
 
 		 765 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  42.5 
 
 		 659 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  43.79 
 
 		 695 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  44.21 
 
 		 727 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  44.65 
 
 		 1240 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.49 
 
 		 659 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>