More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1840 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 645 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 645 aa  641    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 645 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 645 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 637 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.29 
 
 		 626 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.59 
 
 		 630 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 645 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.81 
 
 		 638 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 659 aa  1346    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  66.4 
 
 		 674 aa  870    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  95.9 
 
 		 659 aa  1301    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 645 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 645 aa  637    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  50.49 
 
 		 645 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 645 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  48.47 
 
 		 746 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 645 aa  631  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.56 
 
 		 737 aa  629  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.26 
 
 		 674 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  47.75 
 
 		 745 aa  625  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  46.88 
 
 		 680 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.92 
 
 		 742 aa  623  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  47.33 
 
 		 648 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  47.67 
 
 		 745 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  47.99 
 
 		 745 aa  621  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 		 743 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.46 
 
 		 731 aa  616  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  46.58 
 
 		 725 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 		 743 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  46.77 
 
 		 743 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 		 743 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  47.11 
 
 		 728 aa  618  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  47.67 
 
 		 745 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  46.53 
 
 		 740 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.34 
 
 		 650 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  44.62 
 
 		 740 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  46.12 
 
 		 765 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  43.26 
 
 		 740 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  45.89 
 
 		 749 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  45.22 
 
 		 722 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  44.99 
 
 		 1320 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  47.68 
 
 		 726 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  44.83 
 
 		 744 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.13 
 
 		 732 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  46.08 
 
 		 723 aa  600  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.13 
 
 		 735 aa  601  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.91 
 
 		 721 aa  602  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.87 
 
 		 631 aa  595  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  42.98 
 
 		 755 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  44.58 
 
 		 755 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  42.72 
 
 		 727 aa  595  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  47.26 
 
 		 746 aa  598  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  46.07 
 
 		 785 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.44 
 
 		 807 aa  598  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.89 
 
 		 729 aa  595  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  43.41 
 
 		 764 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.61 
 
 		 728 aa  594  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  44.81 
 
 		 754 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  46.2 
 
 		 733 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.01 
 
 		 631 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  44.5 
 
 		 754 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  43.71 
 
 		 782 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  45.76 
 
 		 735 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  44.5 
 
 		 754 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  43.56 
 
 		 782 aa  588  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.02 
 
 		 639 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.67 
 
 		 739 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  45.43 
 
 		 754 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.92 
 
 		 785 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  44.52 
 
 		 748 aa  591  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  44.05 
 
 		 763 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  43.05 
 
 		 766 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.42 
 
 		 784 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.78 
 
 		 957 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.06 
 
 		 726 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  43.5 
 
 		 774 aa  587  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  44.02 
 
 		 764 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.42 
 
 		 784 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  45.18 
 
 		 729 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  43.73 
 
 		 738 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  45.12 
 
 		 728 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.61 
 
 		 770 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  45.63 
 
 		 632 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  45.4 
 
 		 716 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  43.9 
 
 		 759 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  42.6 
 
 		 712 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.26 
 
 		 768 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.95 
 
 		 736 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.52 
 
 		 732 aa  575  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  44.59 
 
 		 725 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  43.45 
 
 		 736 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  44.43 
 
 		 736 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  45.03 
 
 		 725 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  44.43 
 
 		 728 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.85 
 
 		 646 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  42.53 
 
 		 695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  43.75 
 
 		 732 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  45.1 
 
 		 725 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  47.86 
 
 		 727 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>