More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0398 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  50.62 
 
 		 1240 aa  655    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.46 
 
 		 728 aa  738    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  51.26 
 
 		 768 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  50.54 
 
 		 763 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  64.27 
 
 		 634 aa  867    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.35 
 
 		 729 aa  653    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  50.72 
 
 		 736 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.76 
 
 		 626 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  51.44 
 
 		 740 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 		 755 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  50.4 
 
 		 775 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  50.24 
 
 		 736 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 712 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.14 
 
 		 654 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.96 
 
 		 741 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  47.75 
 
 		 745 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 764 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  50.32 
 
 		 735 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.07 
 
 		 659 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.16 
 
 		 638 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  49.28 
 
 		 741 aa  648    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  58.11 
 
 		 642 aa  749    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.29 
 
 		 723 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  52.24 
 
 		 749 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  49.22 
 
 		 755 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.04 
 
 		 735 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.88 
 
 		 737 aa  709    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50.8 
 
 		 740 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  51.12 
 
 		 716 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  48.56 
 
 		 743 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  51.08 
 
 		 764 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  50.56 
 
 		 736 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  53.5 
 
 		 749 aa  694    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 743 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  48.4 
 
 		 743 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  53.28 
 
 		 728 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  50.87 
 
 		 736 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  47.52 
 
 		 764 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  49.53 
 
 		 765 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.22 
 
 		 1217 aa  722    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 726 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  58.6 
 
 		 677 aa  768    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  47.67 
 
 		 754 aa  645    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  51.78 
 
 		 774 aa  700    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 746 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  53.44 
 
 		 728 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  48.76 
 
 		 756 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  53.99 
 
 		 740 aa  707    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  50.57 
 
 		 834 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  54.7 
 
 		 677 aa  713    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.4 
 
 		 743 aa  657    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  52 
 
 		 716 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  50.39 
 
 		 782 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.22 
 
 		 728 aa  673    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  56.09 
 
 		 625 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  52.15 
 
 		 729 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  53.19 
 
 		 727 aa  679    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  51.92 
 
 		 716 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  52.15 
 
 		 725 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  49.6 
 
 		 736 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  46.89 
 
 		 754 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  51.44 
 
 		 716 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  51.28 
 
 		 716 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  53.34 
 
 		 725 aa  676    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  48.56 
 
 		 743 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.01 
 
 		 785 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.55 
 
 		 784 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  54.31 
 
 		 722 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  48.11 
 
 		 750 aa  641    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  49.6 
 
 		 736 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50 
 
 		 742 aa  659    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  54.39 
 
 		 738 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  53.28 
 
 		 728 aa  683    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.7 
 
 		 732 aa  677    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  50.88 
 
 		 732 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  52.4 
 
 		 766 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.55 
 
 		 784 aa  681    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  49.15 
 
 		 776 aa  665    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.53 
 
 		 631 aa  729    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.31 
 
 		 730 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.04 
 
 		 732 aa  690    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2165  glycogen branching enzyme  49.6 
 
 		 744 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  50.87 
 
 		 755 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  50.88 
 
 		 732 aa  661    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  48.4 
 
 		 743 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  50.7 
 
 		 1224 aa  661    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  51.76 
 
 		 716 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  48.14 
 
 		 759 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  59.33 
 
 		 642 aa  781    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  53.12 
 
 		 723 aa  673    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  52.72 
 
 		 728 aa  658    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  50.88 
 
 		 733 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  51.12 
 
 		 727 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  49.36 
 
 		 731 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 		 749 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.05 
 
 		 768 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.36 
 
 		 770 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.36 
 
 		 732 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.74 
 
 		 760 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.72 
 
 		 631 aa  691    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>