More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4362 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.05 
 
 		 784 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  62.17 
 
 		 764 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.54 
 
 		 646 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.17 
 
 		 635 aa  667    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  53.62 
 
 		 740 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  52.65 
 
 		 725 aa  671    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.41 
 
 		 630 aa  651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  60.16 
 
 		 782 aa  792    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.14 
 
 		 646 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  54.04 
 
 		 754 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.7 
 
 		 668 aa  666    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.02 
 
 		 1217 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.77 
 
 		 659 aa  646    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  50.47 
 
 		 648 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.55 
 
 		 731 aa  664    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  55.75 
 
 		 755 aa  757    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  53.47 
 
 		 677 aa  679    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  49.77 
 
 		 740 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  60.78 
 
 		 763 aa  819    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.72 
 
 		 785 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  60.93 
 
 		 764 aa  825    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.01 
 
 		 631 aa  646    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  54.52 
 
 		 749 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  56.33 
 
 		 764 aa  765    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  56.68 
 
 		 765 aa  766    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.56 
 
 		 732 aa  660    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 		 726 aa  667    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.01 
 
 		 721 aa  677    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  54.88 
 
 		 754 aa  738    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  61.21 
 
 		 774 aa  827    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 740 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  54.88 
 
 		 754 aa  739    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 748 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  49.92 
 
 		 729 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.62 
 
 		 737 aa  724    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.23 
 
 		 636 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.04 
 
 		 742 aa  684    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  55.75 
 
 		 755 aa  756    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  51.46 
 
 		 634 aa  675    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.67 
 
 		 732 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 		 722 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  56.21 
 
 		 756 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  54.97 
 
 		 754 aa  735    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.55 
 
 		 738 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  49.14 
 
 		 728 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.33 
 
 		 728 aa  696    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  56.21 
 
 		 759 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  58.14 
 
 		 776 aa  785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.56 
 
 		 735 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  60.16 
 
 		 782 aa  793    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  51.7 
 
 		 695 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  66.92 
 
 		 659 aa  930    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  51.56 
 
 		 642 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.87 
 
 		 723 aa  662    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  60.31 
 
 		 766 aa  815    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  48.43 
 
 		 785 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 638 aa  645    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.05 
 
 		 784 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.55 
 
 		 631 aa  695    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.55 
 
 		 736 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 654 aa  1366    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  66.92 
 
 		 659 aa  930    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.9 
 
 		 726 aa  634  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  48.43 
 
 		 728 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.3 
 
 		 728 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.14 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  49.69 
 
 		 632 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  48.59 
 
 		 728 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.84 
 
 		 674 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  49 
 
 		 677 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.72 
 
 		 629 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  48.29 
 
 		 727 aa  630  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.36 
 
 		 760 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.51 
 
 		 736 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.68 
 
 		 729 aa  631  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.82 
 
 		 736 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.46 
 
 		 626 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 746 aa  625  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.4 
 
 		 770 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  48.69 
 
 		 716 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 725 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.23 
 
 		 728 aa  625  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.44 
 
 		 748 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  48.52 
 
 		 642 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.55 
 
 		 768 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  47.51 
 
 		 736 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  48.48 
 
 		 643 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  47.99 
 
 		 765 aa  624  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  47.51 
 
 		 736 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  49.14 
 
 		 625 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  47.5 
 
 		 1224 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.88 
 
 		 732 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  47.14 
 
 		 768 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.72 
 
 		 746 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.29 
 
 		 736 aa  615  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 		 716 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  46.73 
 
 		 1240 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.12 
 
 		 633 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  47.14 
 
 		 768 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  48.05 
 
 		 732 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>