More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0840 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.22 
 
 		 784 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  52.91 
 
 		 749 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  53.57 
 
 		 733 aa  653    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  51.27 
 
 		 634 aa  656    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  53.24 
 
 		 736 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  50.55 
 
 		 765 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  55.62 
 
 		 740 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  54.36 
 
 		 775 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  53.99 
 
 		 731 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.44 
 
 		 633 aa  636    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  51.52 
 
 		 746 aa  646    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.03 
 
 		 741 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.12 
 
 		 741 aa  661    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  53.85 
 
 		 732 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.72 
 
 		 743 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  53.24 
 
 		 736 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.12 
 
 		 721 aa  692    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  52.6 
 
 		 741 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  55.64 
 
 		 621 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  53.65 
 
 		 749 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.43 
 
 		 730 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  54.27 
 
 		 750 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.91 
 
 		 737 aa  696    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  59.15 
 
 		 740 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  52.48 
 
 		 716 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 643 aa  1315    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.8 
 
 		 770 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  50.39 
 
 		 764 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  50.46 
 
 		 764 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  55.17 
 
 		 749 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  52.66 
 
 		 743 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  53.55 
 
 		 712 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  53.21 
 
 		 728 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  52.87 
 
 		 1240 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  52.92 
 
 		 736 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  56.46 
 
 		 677 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  72.93 
 
 		 638 aa  948    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  55.68 
 
 		 726 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  54.13 
 
 		 736 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 		 766 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  51.3 
 
 		 774 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  54.11 
 
 		 746 aa  683    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  55.78 
 
 		 748 aa  695    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  53.36 
 
 		 728 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  50.39 
 
 		 763 aa  648    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  55.22 
 
 		 740 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.87 
 
 		 822 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  54.87 
 
 		 768 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  55.73 
 
 		 812 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.21 
 
 		 629 aa  649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1658  glycogen branching enzyme  53.13 
 
 		 721 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0104457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.62 
 
 		 760 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  52.81 
 
 		 727 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  52.62 
 
 		 729 aa  663    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  54.25 
 
 		 748 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  55.54 
 
 		 725 aa  695    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.22 
 
 		 784 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  50.46 
 
 		 782 aa  648    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.93 
 
 		 639 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.8 
 
 		 736 aa  668    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.59 
 
 		 731 aa  716    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.45 
 
 		 736 aa  670    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.57 
 
 		 785 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  50.61 
 
 		 782 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  55.87 
 
 		 722 aa  699    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  54.82 
 
 		 735 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.75 
 
 		 728 aa  711    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.46 
 
 		 631 aa  679    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  53.29 
 
 		 716 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  55.83 
 
 		 738 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  54.06 
 
 		 728 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.04 
 
 		 635 aa  638    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.21 
 
 		 742 aa  649    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.37 
 
 		 732 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.63 
 
 		 735 aa  673    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  52.34 
 
 		 1320 aa  652    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 		 745 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  51.48 
 
 		 745 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  57.73 
 
 		 695 aa  701    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.63 
 
 		 732 aa  673    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  56.76 
 
 		 725 aa  719    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  54.16 
 
 		 732 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  55.82 
 
 		 785 aa  690    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.12 
 
 		 957 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  54.87 
 
 		 768 aa  662    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  53.33 
 
 		 642 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  50.94 
 
 		 723 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  52.11 
 
 		 728 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  51.64 
 
 		 745 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  53.64 
 
 		 727 aa  672    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  53.08 
 
 		 736 aa  664    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.67 
 
 		 754 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  52.84 
 
 		 749 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.33 
 
 		 841 aa  642    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  52.91 
 
 		 732 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.46 
 
 		 1217 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  54.82 
 
 		 735 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.07 
 
 		 631 aa  714    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  75.08 
 
 		 640 aa  992    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  52.93 
 
 		 677 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>