More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3308 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.88 
 
 		 731 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.6 
 
 		 760 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  61.23 
 
 		 634 aa  828    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  50.24 
 
 		 725 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  52.32 
 
 		 740 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.58 
 
 		 646 aa  846    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  52.43 
 
 		 677 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  51.38 
 
 		 736 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.9 
 
 		 784 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.76 
 
 		 726 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.57 
 
 		 785 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  47.94 
 
 		 768 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.32 
 
 		 1217 aa  706    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.08 
 
 		 646 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  56.8 
 
 		 677 aa  757    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.77 
 
 		 633 aa  669    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.72 
 
 		 737 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  50.15 
 
 		 764 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.08 
 
 		 749 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  50.56 
 
 		 785 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.58 
 
 		 639 aa  754    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  62.78 
 
 		 668 aa  850    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  50.4 
 
 		 726 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.72 
 
 		 732 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.23 
 
 		 654 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  50.54 
 
 		 774 aa  675    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.73 
 
 		 659 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.72 
 
 		 748 aa  638    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  51.52 
 
 		 740 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  53.35 
 
 		 642 aa  702    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.45 
 
 		 728 aa  680    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  51.77 
 
 		 632 aa  663    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  51.84 
 
 		 625 aa  675    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 729 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  50.32 
 
 		 748 aa  646    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  53.08 
 
 		 735 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.95 
 
 		 736 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.45 
 
 		 742 aa  641    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  49.85 
 
 		 782 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.24 
 
 		 732 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.68 
 
 		 743 aa  635    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  52.47 
 
 		 722 aa  687    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.97 
 
 		 629 aa  650    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  50.15 
 
 		 766 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.9 
 
 		 784 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.48 
 
 		 738 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 636 aa  1320    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  49.07 
 
 		 776 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  53.57 
 
 		 735 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  52.07 
 
 		 725 aa  661    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.32 
 
 		 730 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.39 
 
 		 631 aa  679    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  49.07 
 
 		 763 aa  659    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  56.3 
 
 		 642 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  52.47 
 
 		 723 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  49.69 
 
 		 782 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 		 731 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  49.69 
 
 		 764 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.7 
 
 		 635 aa  717    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  47.94 
 
 		 768 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.8 
 
 		 631 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 770 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.25 
 
 		 736 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.44 
 
 		 735 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.44 
 
 		 732 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0363  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.37 
 
 		 637 aa  634  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48.09 
 
 		 736 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.61 
 
 		 736 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  50.16 
 
 		 725 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  47.93 
 
 		 736 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 695 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 728 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  48.24 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  47.62 
 
 		 1320 aa  627  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 749 aa  628  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.44 
 
 		 746 aa  626  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 768 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  48.64 
 
 		 728 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.13 
 
 		 743 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  49.13 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.89 
 
 		 728 aa  625  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.52 
 
 		 741 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.64 
 
 		 732 aa  625  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  48.41 
 
 		 749 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.88 
 
 		 761 aa  624  1e-177  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  48.97 
 
 		 743 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 		 728 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  48.18 
 
 		 812 aa  624  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.04 
 
 		 638 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  48.34 
 
 		 755 aa  623  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  48.08 
 
 		 732 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  49.67 
 
 		 727 aa  625  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  48.31 
 
 		 775 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.88 
 
 		 739 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  47.29 
 
 		 741 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  49.13 
 
 		 716 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  45.76 
 
 		 764 aa  621  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  46.44 
 
 		 765 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  49.12 
 
 		 1224 aa  621  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.89 
 
 		 729 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>