More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0363 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.95 
 
 
735 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.37 
 
 
636 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  53.78 
 
 
748 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0363  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 
637 aa  1303    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  54.36 
 
 
740 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  58.9 
 
 
632 aa  711    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  56.35 
 
 
728 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  55.97 
 
 
634 aa  721    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  55.9 
 
 
725 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.54 
 
 
631 aa  642    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  54.32 
 
 
621 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.76 
 
 
760 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.24 
 
 
633 aa  724    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  50.77 
 
 
766 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  53.75 
 
 
764 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  53.41 
 
 
716 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.15 
 
 
631 aa  691    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  52.16 
 
 
764 aa  664    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  55.68 
 
 
749 aa  685    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.95 
 
 
732 aa  666    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  56.19 
 
 
728 aa  685    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.8 
 
 
639 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  50.62 
 
 
782 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  60.74 
 
 
677 aa  773    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  59.39 
 
 
635 aa  734    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  51.84 
 
 
726 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.89 
 
 
784 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  52.23 
 
 
774 aa  670    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  53.8 
 
 
746 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.05 
 
 
785 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  58.88 
 
 
677 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  54.99 
 
 
740 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.3 
 
 
770 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  50.77 
 
 
782 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.35 
 
 
659 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.21 
 
 
621 aa  657    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.89 
 
 
784 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.1 
 
 
728 aa  689    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  58.85 
 
 
625 aa  709    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  52.86 
 
 
729 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  54.68 
 
 
716 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  53.25 
 
 
725 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.99 
 
 
668 aa  727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  53.98 
 
 
716 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  57.88 
 
 
642 aa  708    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.35 
 
 
737 aa  675    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.45 
 
 
768 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  58.19 
 
 
722 aa  703    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  55.54 
 
 
738 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  55.4 
 
 
728 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.88 
 
 
1217 aa  763    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.98 
 
 
646 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  54.26 
 
 
695 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.87 
 
 
822 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  54.3 
 
 
733 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.62 
 
 
646 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  63.59 
 
 
642 aa  794    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.34 
 
 
629 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  52.21 
 
 
727 aa  644    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  51.85 
 
 
763 aa  667    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  52.46 
 
 
736 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  52.61 
 
 
736 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  52.46 
 
 
736 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  53.32 
 
 
716 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.62 
 
 
739 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  53.5 
 
 
716 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.94 
 
 
736 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.21 
 
 
721 aa  629  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  53.49 
 
 
640 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.66 
 
 
731 aa  631  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  50.79 
 
 
731 aa  631  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  52.46 
 
 
736 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  50.31 
 
 
776 aa  631  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.14 
 
 
726 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  54.61 
 
 
723 aa  630  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.25 
 
 
841 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.34 
 
 
742 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  50.32 
 
 
737 aa  626  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  52.46 
 
 
736 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.07 
 
 
736 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  50.24 
 
 
741 aa  624  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  52.45 
 
 
712 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  52.94 
 
 
750 aa  624  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  52.56 
 
 
727 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  51.34 
 
 
735 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  51.26 
 
 
732 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  51.34 
 
 
748 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  51.99 
 
 
725 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  51.99 
 
 
725 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.22 
 
 
741 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  51.94 
 
 
785 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  51.9 
 
 
743 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  51.56 
 
 
812 aa  618  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  51.98 
 
 
736 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  52.87 
 
 
716 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.03 
 
 
732 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5592  glycogen branching enzyme  51.72 
 
 
733 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  51.51 
 
 
731 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  49.45 
 
 
746 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.84 
 
 
747 aa  616  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>