More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2353 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  52.46 
 
 		 754 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.15 
 
 		 721 aa  650    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  52.32 
 
 		 740 aa  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  47.83 
 
 		 785 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.68 
 
 		 1217 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.31 
 
 		 674 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  52.62 
 
 		 754 aa  710    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.08 
 
 		 728 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.48 
 
 		 822 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  59.24 
 
 		 763 aa  798    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2403  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 659 aa  1374    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  53.15 
 
 		 755 aa  716    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.6 
 
 		 785 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.23 
 
 		 737 aa  724    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  51.63 
 
 		 740 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  58.78 
 
 		 764 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.55 
 
 		 630 aa  652    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  52.7 
 
 		 749 aa  696    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.85 
 
 		 736 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.37 
 
 		 748 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  53.22 
 
 		 764 aa  717    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  53.61 
 
 		 765 aa  719    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.39 
 
 		 732 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  48.69 
 
 		 726 aa  648    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  52.3 
 
 		 754 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  58.69 
 
 		 774 aa  788    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  48.6 
 
 		 746 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  48.69 
 
 		 748 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  49.3 
 
 		 740 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  53.15 
 
 		 756 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2353  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 659 aa  1374    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  52.37 
 
 		 677 aa  681    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  48.38 
 
 		 729 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.54 
 
 		 635 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  53.15 
 
 		 755 aa  717    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  50.08 
 
 		 634 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.39 
 
 		 735 aa  650    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  49.16 
 
 		 722 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  59.25 
 
 		 764 aa  789    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  57.27 
 
 		 782 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  51.54 
 
 		 738 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.01 
 
 		 731 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.23 
 
 		 728 aa  683    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.14 
 
 		 732 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  56.82 
 
 		 776 aa  770    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  57.42 
 
 		 782 aa  772    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.69 
 
 		 646 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  51.14 
 
 		 695 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  52.4 
 
 		 725 aa  668    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.31 
 
 		 726 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.07 
 
 		 646 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  52.21 
 
 		 754 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  53.16 
 
 		 759 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  48.62 
 
 		 642 aa  636    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  50.23 
 
 		 723 aa  661    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  50 
 
 		 728 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  48.61 
 
 		 727 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  46.51 
 
 		 731 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  57.81 
 
 		 766 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4362  1,4-alpha-glucan branching enzyme  66.92 
 
 		 654 aa  930    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.4 
 
 		 742 aa  700    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.61 
 
 		 668 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.48 
 
 		 631 aa  690    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  48.33 
 
 		 677 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.97 
 
 		 784 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.97 
 
 		 784 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3200  glycogen branching enzyme  48.94 
 
 		 648 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  48.22 
 
 		 1240 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.22 
 
 		 741 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  48.22 
 
 		 716 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.14 
 
 		 736 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.23 
 
 		 747 aa  630  1e-179  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  48.22 
 
 		 716 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.68 
 
 		 746 aa  631  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  48.14 
 
 		 1224 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  48.46 
 
 		 812 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  47.53 
 
 		 716 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  46.91 
 
 		 728 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.99 
 
 		 638 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  46.27 
 
 		 728 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.13 
 
 		 736 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  46.37 
 
 		 743 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  46.12 
 
 		 728 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  47.75 
 
 		 712 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.04 
 
 		 629 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  48.53 
 
 		 642 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  47.92 
 
 		 716 aa  625  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  46.37 
 
 		 743 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  48.36 
 
 		 632 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  46.21 
 
 		 743 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.62 
 
 		 626 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.45 
 
 		 743 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  48.06 
 
 		 716 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  48.68 
 
 		 640 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.98 
 
 		 633 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  46.21 
 
 		 743 aa  621  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  46.98 
 
 		 736 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.26 
 
 		 743 aa  621  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  46.71 
 
 		 1320 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  46.98 
 
 		 736 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>