More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1127 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 648 aa  1301    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.98 
 
 		 653 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  31.35 
 
 		 593 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  31.36 
 
 		 607 aa  266  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.83 
 
 		 637 aa  231  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  29.92 
 
 		 590 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  29.25 
 
 		 727 aa  203  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.16 
 
 		 623 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  27.68 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.66 
 
 		 741 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.88 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.29 
 
 		 734 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  28.55 
 
 		 741 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.42 
 
 		 957 aa  179  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  27.09 
 
 		 764 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.38 
 
 		 822 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  28.42 
 
 		 733 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  27.63 
 
 		 731 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.84 
 
 		 659 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  27.4 
 
 		 748 aa  173  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  27.84 
 
 		 737 aa  173  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.65 
 
 		 621 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.69 
 
 		 736 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  28.53 
 
 		 755 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.25 
 
 		 633 aa  171  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.06 
 
 		 743 aa  170  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.26 
 
 		 646 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  26.47 
 
 		 765 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  27.63 
 
 		 740 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0939  glycogen branching enzyme  29.67 
 
 		 834 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.62 
 
 		 631 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.88 
 
 		 746 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.96 
 
 		 614 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.22 
 
 		 639 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.69 
 
 		 1320 aa  167  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.09 
 
 		 784 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  27.42 
 
 		 727 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  27.16 
 
 		 740 aa  167  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.09 
 
 		 784 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  26.41 
 
 		 759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.09 
 
 		 785 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  27.48 
 
 		 785 aa  165  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  26.25 
 
 		 774 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.25 
 
 		 732 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  25.49 
 
 		 634 aa  164  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  26.4 
 
 		 759 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  25.29 
 
 		 756 aa  164  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  26.4 
 
 		 759 aa  164  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.19 
 
 		 741 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  25.37 
 
 		 766 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  27.66 
 
 		 642 aa  163  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.45 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.77 
 
 		 732 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.74 
 
 		 635 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3308  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.38 
 
 		 636 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0744248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  27.22 
 
 		 736 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.72 
 
 		 650 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  27.33 
 
 		 1240 aa  160  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  23.57 
 
 		 755 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  30.17 
 
 		 736 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.7 
 
 		 760 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  23.75 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.04 
 
 		 749 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  27.6 
 
 		 812 aa  159  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  26.88 
 
 		 736 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  26.83 
 
 		 1224 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  30.06 
 
 		 736 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  26.54 
 
 		 677 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  30.06 
 
 		 736 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  28.42 
 
 		 768 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  28.42 
 
 		 768 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3773  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.96 
 
 		 639 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  26.3 
 
 		 749 aa  158  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.24 
 
 		 668 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  28 
 
 		 695 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.77 
 
 		 748 aa  156  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.14 
 
 		 754 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  26.27 
 
 		 645 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  26.88 
 
 		 736 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  26.77 
 
 		 741 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.06 
 
 		 739 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  26.2 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.72 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  25.74 
 
 		 736 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  26.13 
 
 		 728 aa  154  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  26.88 
 
 		 736 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 645 aa  153  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.49 
 
 		 732 aa  153  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7032  glycogen branching enzyme  29.96 
 
 		 735 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  25.94 
 
 		 726 aa  153  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  25.76 
 
 		 729 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  24.89 
 
 		 759 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 645 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.89 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  25.94 
 
 		 645 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  25.54 
 
 		 637 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  29.25 
 
 		 750 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  26.97 
 
 		 725 aa  151  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  24.78 
 
 		 764 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.67 
 
 		 737 aa  151  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>