More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1955 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.32 
 
 		 742 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  48.55 
 
 		 736 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  52.64 
 
 		 741 aa  769    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.62 
 
 		 732 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  48.3 
 
 		 736 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  65.21 
 
 		 759 aa  981    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  48.26 
 
 		 740 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  48.7 
 
 		 775 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.16 
 
 		 736 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.7 
 
 		 784 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  51.37 
 
 		 725 aa  707    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.35 
 
 		 741 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.42 
 
 		 1217 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.72 
 
 		 743 aa  823    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  55.84 
 
 		 1240 aa  811    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  65.05 
 
 		 741 aa  979    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  46.81 
 
 		 741 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.37 
 
 		 739 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  59.72 
 
 		 749 aa  848    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  45.29 
 
 		 755 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.59 
 
 		 631 aa  674    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.54 
 
 		 614 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50.54 
 
 		 740 aa  697    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.93 
 
 		 732 aa  669    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.56 
 
 		 784 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  50.2 
 
 		 748 aa  696    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  45.82 
 
 		 764 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.37 
 
 		 721 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  46.97 
 
 		 749 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  47.69 
 
 		 743 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  50.4 
 
 		 728 aa  707    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.4 
 
 		 770 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0919  glycogen branching enzyme  46.4 
 
 		 764 aa  636    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.144042  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1018  glycogen branching enzyme  46.33 
 
 		 765 aa  638    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.650452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  52.76 
 
 		 638 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  48.57 
 
 		 726 aa  710    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  47.41 
 
 		 735 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  47.13 
 
 		 735 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  45.24 
 
 		 774 aa  650    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  46.17 
 
 		 746 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  52.29 
 
 		 677 aa  657    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  50.4 
 
 		 728 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4391  glycogen branching enzyme  47.83 
 
 		 741 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.470909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  49.6 
 
 		 740 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  47.98 
 
 		 768 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0415  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.77 
 
 		 723 aa  649    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  61.98 
 
 		 812 aa  894    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  43.17 
 
 		 782 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  46.39 
 
 		 736 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  46.47 
 
 		 735 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  56.28 
 
 		 732 aa  810    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  47.8 
 
 		 729 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.38 
 
 		 747 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  48.27 
 
 		 737 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  47.13 
 
 		 725 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  46.94 
 
 		 736 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  61.03 
 
 		 754 aa  899    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  45.01 
 
 		 766 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.56 
 
 		 760 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  47.56 
 
 		 732 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  49.86 
 
 		 727 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  64.93 
 
 		 759 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  50.14 
 
 		 722 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46 
 
 		 737 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.89 
 
 		 736 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  47.48 
 
 		 727 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  49.93 
 
 		 728 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  48.33 
 
 		 738 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  49.53 
 
 		 725 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.83 
 
 		 785 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  47.15 
 
 		 727 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  65.45 
 
 		 731 aa  985    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  53.42 
 
 		 776 aa  777    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.46 
 
 		 768 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  45.04 
 
 		 759 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48.57 
 
 		 736 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  52.34 
 
 		 695 aa  688    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  47.98 
 
 		 768 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  52.58 
 
 		 750 aa  799    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  48.1 
 
 		 732 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  60.47 
 
 		 755 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  55.33 
 
 		 1224 aa  800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  45.59 
 
 		 763 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  45.02 
 
 		 755 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.77 
 
 		 822 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  45.94 
 
 		 723 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  47.19 
 
 		 728 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.38 
 
 		 728 aa  693    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  60 
 
 		 727 aa  888    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  49.25 
 
 		 731 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  54.83 
 
 		 749 aa  805    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.62 
 
 		 732 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  64.93 
 
 		 759 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.24 
 
 		 728 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  65.36 
 
 		 737 aa  975    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.55 
 
 		 631 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  52.78 
 
 		 640 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  46.65 
 
 		 733 aa  643    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  57.75 
 
 		 1320 aa  848    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  47.31 
 
 		 712 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>