More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3771 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  57.31 
 
 		 759 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.85 
 
 		 746 aa  657    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  56.58 
 
 		 732 aa  643    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  56.15 
 
 		 957 aa  681    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.07 
 
 		 734 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.99 
 
 		 743 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.47 
 
 		 822 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  58.5 
 
 		 749 aa  682    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  58.54 
 
 		 755 aa  676    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  56.33 
 
 		 1240 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  56.95 
 
 		 785 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  58.67 
 
 		 736 aa  680    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.9 
 
 		 743 aa  651    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  57.94 
 
 		 812 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  56.89 
 
 		 748 aa  669    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.87 
 
 		 754 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  57.1 
 
 		 726 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  56.98 
 
 		 759 aa  686    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  56.56 
 
 		 731 aa  672    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.85 
 
 		 732 aa  663    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  55.59 
 
 		 1320 aa  655    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  63.64 
 
 		 638 aa  747    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  55.67 
 
 		 741 aa  678    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  56.33 
 
 		 1224 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  55.54 
 
 		 741 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3771  1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 614 aa  1241    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  58.81 
 
 		 727 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  54.15 
 
 		 749 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  56.98 
 
 		 759 aa  686    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03850  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  54.05 
 
 		 776 aa  635    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.914445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  56.49 
 
 		 737 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.59 
 
 		 839 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  52.67 
 
 		 750 aa  627  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.48 
 
 		 761 aa  615  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1729  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.31 
 
 		 741 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.844267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.34 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.66 
 
 		 731 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  49.75 
 
 		 726 aa  601  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  51.99 
 
 		 728 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  51.99 
 
 		 728 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  51.83 
 
 		 728 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  52.61 
 
 		 722 aa  591  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  52.12 
 
 		 738 aa  588  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.37 
 
 		 732 aa  588  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  53.13 
 
 		 640 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  49.84 
 
 		 740 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  54.26 
 
 		 736 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.49 
 
 		 631 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  51.58 
 
 		 725 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  49.59 
 
 		 749 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 770 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  51 
 
 		 625 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  50.83 
 
 		 677 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  53.57 
 
 		 1217 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  51.75 
 
 		 768 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.85 
 
 		 785 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.51 
 
 		 784 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.74 
 
 		 740 aa  569  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  51.75 
 
 		 768 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.51 
 
 		 784 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  52.13 
 
 		 695 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  52.71 
 
 		 632 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  52.75 
 
 		 775 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  52.15 
 
 		 621 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  52.58 
 
 		 750 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3113  glycogen branching enzyme  49.92 
 
 		 638 aa  566  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.93 
 
 		 728 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5489  glycogen branching enzyme  51.62 
 
 		 732 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461102  decreased coverage  0.0000652942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.41 
 
 		 659 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 		 748 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.58 
 
 		 635 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  52.24 
 
 		 725 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5384  glycogen branching enzyme  50.34 
 
 		 737 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  0.712549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.08 
 
 		 841 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  49.83 
 
 		 736 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  49.83 
 
 		 736 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6086  glycogen branching enzyme  50.57 
 
 		 736 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.133555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50.33 
 
 		 740 aa  561  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  51.23 
 
 		 638 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  49.34 
 
 		 736 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  50.6 
 
 		 746 aa  559  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0151  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.41 
 
 		 639 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.98 
 
 		 668 aa  558  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  52.23 
 
 		 677 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.16 
 
 		 741 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  47.36 
 
 		 634 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.02 
 
 		 633 aa  558  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 732 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.25 
 
 		 735 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.5 
 
 		 721 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.7 
 
 		 768 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  49.17 
 
 		 731 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  50.97 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00541672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  46.63 
 
 		 729 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.99 
 
 		 737 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  50.58 
 
 		 725 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1332  glycogen branching enzyme  50.41 
 
 		 736 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802487  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6497  glycogen branching enzyme  50.41 
 
 		 736 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1265  glycogen branching enzyme  50.9 
 
 		 642 aa  555  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  48.21 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>