More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03850 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  55.09 
 
 
741 aa  801    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03284  glycogen branching enzyme  46.25 
 
 
728 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0237204  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0282  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.25 
 
 
728 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.890555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1104  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.29 
 
 
729 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  47.21 
 
 
732 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  46.51 
 
 
743 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  48.82 
 
 
736 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  48.65 
 
 
768 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  47.24 
 
 
740 aa  651    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0239  glycogen branching enzyme  49.62 
 
 
775 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0137851  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  55.24 
 
 
750 aa  823    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  49.26 
 
 
712 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  46.77 
 
 
746 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.95 
 
 
741 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  46.97 
 
 
745 aa  676    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.2 
 
 
732 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  46.51 
 
 
743 aa  659    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  49.21 
 
 
716 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4744  glycogen branching enzyme  46.25 
 
 
728 aa  643    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  45.9 
 
 
741 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3911  glycogen branching enzyme  46.25 
 
 
728 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  63.02 
 
 
749 aa  900    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3321  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.82 
 
 
728 aa  663    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4229  glycogen branching enzyme  51.05 
 
 
750 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  44.58 
 
 
742 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  50.65 
 
 
740 aa  698    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1207  glycogen branching enzyme  49.38 
 
 
716 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  48.09 
 
 
727 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  45.01 
 
 
764 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0280  glycogen branching enzyme  46.25 
 
 
728 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.388281  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  46.54 
 
 
749 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  47.44 
 
 
743 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  51.46 
 
 
728 aa  705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  51.33 
 
 
728 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.95 
 
 
785 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  46.65 
 
 
728 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.19 
 
 
728 aa  702    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.45 
 
 
737 aa  677    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  46.78 
 
 
728 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  48.55 
 
 
726 aa  695    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  48.82 
 
 
736 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  49.22 
 
 
725 aa  666    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  45.8 
 
 
743 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  46.52 
 
 
728 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  59.95 
 
 
755 aa  852    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  46.64 
 
 
743 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  50.13 
 
 
740 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  45.57 
 
 
728 aa  635    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03669  glycogen branching enzyme  50.47 
 
 
727 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  60.05 
 
 
812 aa  852    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  48.94 
 
 
716 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  48.68 
 
 
736 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.94 
 
 
739 aa  663    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5563  glycogen branching enzyme  45.29 
 
 
735 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  45.62 
 
 
729 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  48.55 
 
 
736 aa  677    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  46.78 
 
 
728 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  47.23 
 
 
733 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2863  glycogen branching enzyme  47.17 
 
 
736 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  46.59 
 
 
763 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1464  glycogen branching enzyme  48.74 
 
 
716 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  60.5 
 
 
732 aa  882    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.95 
 
 
735 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  55.21 
 
 
759 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  52.76 
 
 
722 aa  719    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  50.27 
 
 
748 aa  664    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3714  glycogen branching enzyme  46.39 
 
 
728 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470927  normal  0.781278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  55.47 
 
 
759 aa  800    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  49.87 
 
 
725 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  50.99 
 
 
738 aa  714    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  51.17 
 
 
728 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  47.04 
 
 
736 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  55.86 
 
 
731 aa  805    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.95 
 
 
732 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0889  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.61 
 
 
807 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  46.78 
 
 
728 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  46.33 
 
 
745 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  46.46 
 
 
745 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  52.18 
 
 
695 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.25 
 
 
747 aa  647    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3892  glycogen branching enzyme  46.12 
 
 
728 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  60.39 
 
 
1240 aa  899    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  47.88 
 
 
732 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.64 
 
 
784 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  62.16 
 
 
1224 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.31 
 
 
631 aa  637    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.77 
 
 
784 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  46.98 
 
 
735 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  44.72 
 
 
728 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  46.59 
 
 
745 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  58.54 
 
 
727 aa  857    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3632  glycogen branching enzyme  46.25 
 
 
728 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  47.77 
 
 
731 aa  677    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  57.99 
 
 
749 aa  842    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.74 
 
 
841 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  55.21 
 
 
759 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  44.46 
 
 
766 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  55.1 
 
 
737 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  51.31 
 
 
631 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  53.93 
 
 
640 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>