More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5116 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  100 
 
 		 653 aa  1340    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  53.98 
 
 		 648 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.89 
 
 		 607 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  30.1 
 
 		 637 aa  233  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  30.15 
 
 		 590 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.79 
 
 		 623 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  28.62 
 
 		 560 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.44 
 
 		 734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.33 
 
 		 659 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  27.36 
 
 		 733 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  27.58 
 
 		 737 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 		 740 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.59 
 
 		 726 aa  174  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  27.35 
 
 		 736 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  27.35 
 
 		 736 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  28.16 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  26.78 
 
 		 748 aa  172  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.69 
 
 		 1320 aa  172  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.3 
 
 		 633 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.71 
 
 		 741 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  26.09 
 
 		 645 aa  170  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.91 
 
 		 741 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  27.57 
 
 		 1224 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.23 
 
 		 650 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1806  glycogen branching enzyme  27.34 
 
 		 749 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  25.82 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  25.82 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.96 
 
 		 631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  27.83 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  25.47 
 
 		 645 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  25.66 
 
 		 645 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  25.2 
 
 		 645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  25.66 
 
 		 645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  25.66 
 
 		 645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  26.79 
 
 		 736 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  27.11 
 
 		 1240 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  26.48 
 
 		 727 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  25.39 
 
 		 637 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.71 
 
 		 732 aa  164  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  26.79 
 
 		 736 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  26.11 
 
 		 749 aa  163  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.38 
 
 		 822 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 876 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.19 
 
 		 731 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.31 
 
 		 785 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.05 
 
 		 732 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  27.61 
 
 		 728 aa  160  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.33 
 
 		 784 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  24.32 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.27 
 
 		 728 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  26.56 
 
 		 746 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  26.74 
 
 		 741 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  27.98 
 
 		 728 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.33 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  27.8 
 
 		 728 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  27.13 
 
 		 732 aa  159  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  25.16 
 
 		 645 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.65 
 
 		 631 aa  158  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0398  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.36 
 
 		 646 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.930731  normal  0.93639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1559  glycogen branching enzyme  24.96 
 
 		 659 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.018797  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.08 
 
 		 841 aa  158  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1334  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.89 
 
 		 743 aa  157  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.87 
 
 		 736 aa  157  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  27.15 
 
 		 695 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  26.14 
 
 		 731 aa  157  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  26.63 
 
 		 743 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  26.59 
 
 		 768 aa  157  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  27.95 
 
 		 731 aa  157  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  26.59 
 
 		 768 aa  157  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  25.69 
 
 		 746 aa  157  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  26.56 
 
 		 745 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  26.6 
 
 		 728 aa  157  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  25.51 
 
 		 680 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  25.57 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2046  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.63 
 
 		 730 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.026483  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  26.71 
 
 		 745 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.28 
 
 		 957 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  24.88 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3504  glycogen branching enzyme  25.51 
 
 		 645 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.5 
 
 		 736 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.49 
 
 		 754 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.46 
 
 		 638 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3233  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.61 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  26.87 
 
 		 785 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  26.19 
 
 		 716 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.37 
 
 		 761 aa  154  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  25.2 
 
 		 742 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  26.71 
 
 		 745 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  27.08 
 
 		 716 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0277  glycogen branching enzyme  25.89 
 
 		 727 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  25.26 
 
 		 765 aa  154  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.15 
 
 		 732 aa  153  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.15 
 
 		 735 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1840  glycogen branching enzyme  24.67 
 
 		 659 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  26.32 
 
 		 740 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.96 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  24.12 
 
 		 729 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  24.66 
 
 		 727 aa  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  25.97 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>