More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2027 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 876 aa  1746    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  43.46 
 
 		 818 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  43.09 
 
 		 827 aa  623  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0342  alpha amylase all-beta  43.08 
 
 		 854 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  31.73 
 
 		 590 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.92 
 
 		 637 aa  207  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.46 
 
 		 623 aa  191  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.99 
 
 		 629 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.07 
 
 		 629 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.5 
 
 		 618 aa  179  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.23 
 
 		 607 aa  174  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  28.15 
 
 		 552 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.5 
 
 		 731 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  28.21 
 
 		 732 aa  168  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 606 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  28.7 
 
 		 740 aa  164  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.74 
 
 		 614 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 552 aa  161  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  29.09 
 
 		 625 aa  161  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.04 
 
 		 605 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  29.65 
 
 		 749 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.36 
 
 		 586 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.35 
 
 		 736 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.05 
 
 		 621 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.64 
 
 		 653 aa  159  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  29.27 
 
 		 560 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  27.84 
 
 		 732 aa  157  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.77 
 
 		 605 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  25.88 
 
 		 749 aa  157  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  27.4 
 
 		 733 aa  157  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  27.18 
 
 		 736 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  29.23 
 
 		 748 aa  155  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  23.21 
 
 		 608 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.23 
 
 		 741 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  27.18 
 
 		 736 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.02 
 
 		 613 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  26.52 
 
 		 1320 aa  153  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  27.18 
 
 		 736 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.71 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19050  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.21 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.217286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2740  glycogen branching enzyme  26.51 
 
 		 736 aa  153  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.296268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  27.82 
 
 		 677 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0853  glycogen branching enzyme  25.23 
 
 		 622 aa  151  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00164465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  26.01 
 
 		 729 aa  151  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  28.48 
 
 		 725 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  25.5 
 
 		 645 aa  151  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0257  glycogen branching enzyme  26.46 
 
 		 737 aa  150  8e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  27.13 
 
 		 554 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  27.89 
 
 		 1224 aa  150  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  29.19 
 
 		 728 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  25.18 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.48 
 
 		 732 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.48 
 
 		 735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  25.18 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  25.21 
 
 		 645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  25.46 
 
 		 645 aa  149  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  25.46 
 
 		 645 aa  149  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  24.66 
 
 		 680 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.95 
 
 		 612 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  25.32 
 
 		 645 aa  148  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  25.89 
 
 		 743 aa  148  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  25.32 
 
 		 645 aa  148  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  26.29 
 
 		 630 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  27.15 
 
 		 740 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  24.89 
 
 		 637 aa  147  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.36 
 
 		 610 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.65 
 
 		 732 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.66 
 
 		 659 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  26.22 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2491  glycogen branching enzyme  26.1 
 
 		 741 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00781855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  24.3 
 
 		 638 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3937  glycogen branching enzyme  27.47 
 
 		 768 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.41 
 
 		 731 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4050  glycogen branching enzyme  27.47 
 
 		 768 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.52 
 
 		 631 aa  146  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4710  glycogen branching enzyme  24.03 
 
 		 645 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  28.03 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  28.12 
 
 		 740 aa  145  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.07 
 
 		 721 aa  145  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  26.79 
 
 		 746 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  28.25 
 
 		 695 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  27.06 
 
 		 640 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  26.97 
 
 		 638 aa  144  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1278  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.65 
 
 		 734 aa  144  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  25.17 
 
 		 776 aa  144  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.87 
 
 		 610 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.89 
 
 		 1217 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.01 
 
 		 754 aa  143  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.78 
 
 		 561 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5099  glycogen branching enzyme  26.16 
 
 		 736 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0222717  normal  0.0266219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0246  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.54 
 
 		 839 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  28.06 
 
 		 736 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  25.66 
 
 		 726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  25.9 
 
 		 729 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.08 
 
 		 668 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26 
 
 		 640 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.29 
 
 		 621 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  25.15 
 
 		 730 aa  142  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 		 722 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>