More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0213 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  100 
 
 
607 aa  1261    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  56.25 
 
 
593 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  48.8 
 
 
637 aa  622  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  46.26 
 
 
590 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.69 
 
 
623 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.73 
 
 
653 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  31.36 
 
 
648 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  33.51 
 
 
729 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  30.88 
 
 
742 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  29.56 
 
 
748 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  30.22 
 
 
729 aa  251  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 
560 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  30.44 
 
 
740 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1168  glycogen branching enzyme  29.27 
 
 
765 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.159491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  30.16 
 
 
730 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3094  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.64 
 
 
646 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302104  normal  0.0711873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  28.64 
 
 
654 aa  234  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  28.3 
 
 
740 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.96 
 
 
768 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03375  glycogen branching enzyme  29.27 
 
 
728 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.98 
 
 
739 aa  228  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  29.28 
 
 
716 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.33 
 
 
731 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6323  glycogen branching enzyme  29.06 
 
 
712 aa  228  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0125562  normal  0.86015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.31 
 
 
785 aa  227  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  28.46 
 
 
638 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  29.48 
 
 
743 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1882  glycogen branching enzyme  28.77 
 
 
716 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655867  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  29.48 
 
 
743 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  30.1 
 
 
731 aa  226  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.47 
 
 
784 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.47 
 
 
784 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0238  glycogen branching enzyme  27.9 
 
 
645 aa  224  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0276021  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  29.31 
 
 
743 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3937  glycogen branching enzyme  29.45 
 
 
725 aa  224  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  29.31 
 
 
743 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  28.55 
 
 
745 aa  223  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0558  glycogen branching enzyme  29.17 
 
 
680 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  29.09 
 
 
728 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4136  glycogen branching enzyme  29.45 
 
 
725 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06101  glycogen branching enzyme  28.13 
 
 
754 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3348  glycogen branching enzyme  29.32 
 
 
735 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  31.05 
 
 
728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2758  glycogen branching enzyme  28.91 
 
 
745 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2836  glycogen branching enzyme  29.41 
 
 
745 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  30.88 
 
 
728 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.9 
 
 
650 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  28.14 
 
 
755 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  28.53 
 
 
771 aa  221  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  27.98 
 
 
755 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0542  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.45 
 
 
732 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.258391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3760  glycogen branching enzyme  27.9 
 
 
749 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3650  glycogen branching enzyme  29.2 
 
 
735 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  27.81 
 
 
631 aa  220  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0586  glycogen branching enzyme  29.55 
 
 
621 aa  220  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10681  glycogen branching enzyme  29.06 
 
 
759 aa  219  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134433  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1494  glycogen branching enzyme  29.6 
 
 
746 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06401  glycogen branching enzyme  27.83 
 
 
754 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.556362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.34 
 
 
631 aa  219  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  29.71 
 
 
722 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.99 
 
 
770 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4999  glycogen branching enzyme  27.27 
 
 
645 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3728  glycogen branching enzyme  28.41 
 
 
728 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.636396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3680  glycogen branching enzyme  28.26 
 
 
716 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3805  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 
728 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2934  glycogen branching enzyme  29.58 
 
 
745 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.8 
 
 
841 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.94 
 
 
735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0511  glycogen branching enzyme  28.65 
 
 
726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.971764  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0584  glycogen branching enzyme  27.68 
 
 
754 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  28.94 
 
 
640 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5028  glycogen branching enzyme  28.31 
 
 
645 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  28.34 
 
 
725 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3847  glycogen branching enzyme  28.25 
 
 
728 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.579586  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3908  glycogen branching enzyme  28.57 
 
 
728 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.635495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  28.17 
 
 
738 aa  217  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.94 
 
 
732 aa  217  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.93 
 
 
728 aa  217  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3739  glycogen branching enzyme  28.41 
 
 
728 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4647  glycogen branching enzyme  30.56 
 
 
728 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.616835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  30.19 
 
 
760 aa  216  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5009  glycogen branching enzyme  28.14 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4761  glycogen branching enzyme  28.19 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5123  glycogen branching enzyme  28.19 
 
 
645 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3484  glycogen branching enzyme  28.48 
 
 
716 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.53 
 
 
731 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06491  glycogen branching enzyme  27.83 
 
 
754 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.930927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.21 
 
 
630 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  28.67 
 
 
740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  28.52 
 
 
725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6823  glycogen branching enzyme  29.89 
 
 
736 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.851597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0840  glycogen branching enzyme  29.43 
 
 
643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.049249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4599  glycogen branching enzyme  28.19 
 
 
645 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4621  glycogen branching enzyme  28.11 
 
 
637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  30.23 
 
 
712 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3840  glycogen branching enzyme  28.21 
 
 
728 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.933712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  29.57 
 
 
733 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4980  glycogen branching enzyme  28.19 
 
 
645 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  29.33 
 
 
743 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0223  glycogen branching enzyme  28.66 
 
 
727 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>