More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4479 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  57.4 
 
 		 554 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  77.36 
 
 		 552 aa  936    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  75.77 
 
 		 551 aa  899    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 552 aa  1145    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  64.97 
 
 		 543 aa  772    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  39.4 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  35.93 
 
 		 560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 		 593 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  28.44 
 
 		 607 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  28.86 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  26.91 
 
 		 637 aa  180  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.69 
 
 		 608 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  27.32 
 
 		 990 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.65 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  28.75 
 
 		 623 aa  169  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  27.45 
 
 		 876 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.94 
 
 		 610 aa  160  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.58 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  28.26 
 
 		 818 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.75 
 
 		 605 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.58 
 
 		 605 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.54 
 
 		 621 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.45 
 
 		 618 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  26.81 
 
 		 754 aa  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.62 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.51 
 
 		 621 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  25.24 
 
 		 653 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.59 
 
 		 596 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.24 
 
 		 577 aa  148  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.87 
 
 		 593 aa  147  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6084  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.45 
 
 		 623 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800563  normal  0.517513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  24.79 
 
 		 958 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1334  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.17 
 
 		 623 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0628361  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6495  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.17 
 
 		 623 aa  144  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0784171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1127  glycoside hydrolase family 13 protein  27.22 
 
 		 648 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.1 
 
 		 587 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.02 
 
 		 594 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.24 
 
 		 601 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  25.14 
 
 		 625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  26.73 
 
 		 640 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  26.78 
 
 		 729 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  28.51 
 
 		 745 aa  140  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  26.57 
 
 		 748 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  25.2 
 
 		 712 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.74 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  28.07 
 
 		 630 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 600 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  26.13 
 
 		 850 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.75 
 
 		 612 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.86 
 
 		 581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.35 
 
 		 586 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5594  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.84 
 
 		 623 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.774422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.19 
 
 		 640 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2989  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.17 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.9 
 
 		 642 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  25.8 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0359  alpha amylase, catalytic region  27.2 
 
 		 827 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0267919  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  26.07 
 
 		 848 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6324  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.84 
 
 		 623 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0602063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  26.25 
 
 		 742 aa  136  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.55 
 
 		 630 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  37.04 
 
 		 937 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  25.8 
 
 		 852 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.85 
 
 		 606 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2539  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.13 
 
 		 626 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000367182 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.18 
 
 		 592 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.1 
 
 		 640 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  27.62 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  27.62 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.62 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  27.62 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  27.62 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3664  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.57 
 
 		 659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186742  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  25.94 
 
 		 852 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  25.94 
 
 		 852 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2450  putative Alpha-amylase  26.96 
 
 		 592 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.17 
 
 		 604 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1682  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.54 
 
 		 626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.166285  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5487  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.62 
 
 		 619 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.570083  hitchhiker  0.000688903 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1417  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.7 
 
 		 629 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  25.94 
 
 		 852 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.73 
 
 		 592 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.41 
 
 		 586 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.89 
 
 		 672 aa  133  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.26 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.26 
 
 		 713 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.86 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.7 
 
 		 713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  26.26 
 
 		 713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  28.61 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.69 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.26 
 
 		 713 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.39 
 
 		 613 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  26.22 
 
 		 713 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.39 
 
 		 613 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.99 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.27 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36580  putative glycosyl hydrolase  27.61 
 
 		 583 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0581511  normal  0.753137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3142  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.86 
 
 		 583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0936005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>