More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17070  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  100 
 
 		 654 aa  1363    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2074  glycogen branching enzyme  51.44 
 
 		 725 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.296286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2191  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.33 
 
 		 737 aa  634  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0053  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.02 
 
 		 742 aa  627  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0344154  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0316  glycogen branching enzyme  49.61 
 
 		 722 aa  621  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06930  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.67 
 
 		 630 aa  615  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2861  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.69 
 
 		 726 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0818  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.08 
 
 		 674 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.82 
 
 		 728 aa  614  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1518  glycogen branching enzyme  49.92 
 
 		 728 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8169  glycogen branching enzyme  48.35 
 
 		 785 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1367  glycogen branching enzyme  49.44 
 
 		 725 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0327  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47 
 
 		 731 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1226  glycogen branching enzyme  46.7 
 
 		 766 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2960  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.44 
 
 		 633 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0465  glycogen branching enzyme  46.93 
 
 		 782 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.498209  normal  0.561272 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1085  glycogen branching enzyme  46.97 
 
 		 774 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0775  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.37 
 
 		 721 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2677  glycogen branching enzyme  47.99 
 
 		 738 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810703  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0452  glycogen branching enzyme  46.78 
 
 		 782 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0562  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.34 
 
 		 638 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2162  glycogen branching enzyme  49.76 
 
 		 625 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750455  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0676  glycogen branching enzyme  46.61 
 
 		 727 aa  599  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214818  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1111  glycogen branching enzyme  48.5 
 
 		 728 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.827586  normal  0.454122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2941  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.26 
 
 		 784 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595342  hitchhiker  0.00590873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2714  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.26 
 
 		 784 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0904  glycogen branching enzyme  47.29 
 
 		 749 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2448  glycogen branching enzyme  48.34 
 
 		 728 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.94 
 
 		 785 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.573096  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1530  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.65 
 
 		 736 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.473268  hitchhiker  0.0000810495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1783  glycogen branching enzyme  48.03 
 
 		 728 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1453  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.69 
 
 		 626 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0739  glycogen branching enzyme  47.24 
 
 		 1224 aa  598  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.345275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2091  glycogen branching enzyme  49.04 
 
 		 677 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3603  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.77 
 
 		 736 aa  595  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.747738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2058  glycogen branching enzyme  47.29 
 
 		 740 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0222807  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0717  glycogen branching enzyme  47.92 
 
 		 746 aa  593  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0863  glycogen branching enzyme  47.4 
 
 		 1240 aa  595  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1392  glycogen branching enzyme  47.75 
 
 		 723 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1978  glycogen branching enzyme  49.69 
 
 		 632 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2836  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.09 
 
 		 732 aa  591  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2458  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.09 
 
 		 735 aa  592  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.106606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.22 
 
 		 761 aa  586  1e-166  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.983775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2285  glycogen branching enzyme  49.28 
 
 		 638 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  45.28 
 
 		 674 aa  585  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0958  glycogen branching enzyme  48.97 
 
 		 695 aa  587  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3960  1,4-alpha-glucan branching protein  45.15 
 
 		 763 aa  587  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3451  glycogen branching enzyme  48.9 
 
 		 642 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000151331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4120  glycogen branching enzyme  46.46 
 
 		 764 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0999  glycogen branching enzyme  47.49 
 
 		 640 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.970102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2024  glycogen branching enzyme  49.15 
 
 		 677 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.136929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  47.54 
 
 		 736 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1475  glycogen branching enzyme  47.21 
 
 		 740 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4095  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.56 
 
 		 659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0557741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0558  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.13 
 
 		 650 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000187675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.08 
 
 		 631 aa  585  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2576  glycogen branching enzyme  46.7 
 
 		 740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.894399  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1105  glycogen branching enzyme  48.49 
 
 		 748 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  47.7 
 
 		 736 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09520  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  47.57 
 
 		 1320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.100278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3093  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.4 
 
 		 754 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000057482  decreased coverage  0.000000447753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2762  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.54 
 
 		 741 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  47.23 
 
 		 736 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0582  glycogen branching enzyme  46.55 
 
 		 749 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4616  glycogen branching enzyme  45.05 
 
 		 764 aa  582  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.490681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3070  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.72 
 
 		 1217 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34783  normal  0.34128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  47.54 
 
 		 736 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11358  glycogen branching enzyme  47.14 
 
 		 731 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000136152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0036  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1434  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.7 
 
 		 631 aa  582  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944975  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1597  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.82 
 
 		 760 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2421  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.33 
 
 		 746 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2745  glycogen branching enzyme  45.21 
 
 		 634 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  47.36 
 
 		 732 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1049  glycogen branching enzyme  47.82 
 
 		 755 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145385  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2536  glycogen branching enzyme  46.76 
 
 		 743 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0752  glycogen branching enzyme  46.35 
 
 		 750 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3681  glycogen branching enzyme  47.1 
 
 		 812 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.024212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1886  1,4-alpha-glucan branching enzyme  49.83 
 
 		 621 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10310  alpha-1,4-glucan:alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase  48.65 
 
 		 748 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27990  glycogen branching enzyme  46.72 
 
 		 733 aa  572  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2343  glycogen branching enzyme  46.61 
 
 		 741 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  47.2 
 
 		 732 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4302  glycogen branching enzyme  46.97 
 
 		 737 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3844  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.68 
 
 		 747 aa  568  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6075  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.78 
 
 		 822 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4103  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.51 
 
 		 957 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1837  glycogen branching enzyme  44.13 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  46.57 
 
 		 759 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  47.47 
 
 		 730 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6806  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.47 
 
 		 770 aa  567  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.606577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0215  1,4-alpha-glucan branching enzyme  47.2 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1294  1,4-alpha-glucan branching enzyme  45.04 
 
 		 732 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  45.58 
 
 		 729 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  46.57 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4428  glycogen branching enzyme  45.69 
 
 		 731 aa  568  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  46.57 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1955  1,4-alpha-glucan branching enzyme  46.02 
 
 		 668 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10284 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1133  glycogen branching enzyme  45.98 
 
 		 725 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7545  1,4-alpha-glucan branching enzyme  48.48 
 
 		 768 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>